未來的製藥實驗室內部 - 彭博社
Matthew Campbell, Johannes Koch
在她作為藥物研究員的工作中,烏爾裏克·裏德使用一些最先進和最敏感的實驗室設備。但當需要整理結果時,她常常在機器之間穿梭以收集信息。“我必須逐個設備去轉移數據或遠程訪問每個設備,”瑞德説,她是瑞士生物技術公司Philochem的生物學家。“如果所有實驗室設備能夠以某種方式連接起來,那將會有所幫助。”
正如他們所説,有一個應用程序可以解決這個問題——而且很快會有很多,因為製藥公司、實驗室設備製造商和初創公司都在尋求解決這個問題。儘管基因測序儀、離心機和生物反應器等機器的技術不斷進步,但單個設備之間很少相互通信。在許多實驗室中,技術人員依賴屏幕截圖、筆和紙來共享數據,這是一種低效的過程,增加了出錯的風險。“有很多手動輸入,”製藥公司百時美施貴寶的高管達娜·範德沃爾説。研究人員應該能夠“專注於科學研究,而不是關注這或那件設備或這或那種數據格式的特性。”
“我必須逐個設備去轉移數據或遠程訪問每個設備。如果所有實驗室設備能夠以某種方式連接起來,那將會有所幫助。” —烏爾裏克·裏德,Philochem生物學家
德國默克KGaA正在開發一種軟件,可以自動化實驗並預測機器何時即將耗盡化學品或其他材料,然後允許一鍵訂購供應——正如默克高管烏迪特·巴特拉所説的“生命科學的亞馬遜”。葛蘭素史克、百時美施貴寶以及十多家公司正在通過非營利組織Allotrope Foundation合作,開發實驗室數據的共同標準。支持者表示,這些標準有一天可以像HTML為網站提供通用語言一樣組織科學結果,無論使用何種瀏覽器。
簡化研究過程的努力受到大量實驗室設備製造公司的阻礙。它們都有自己的軟件,對於複雜的實驗,每台機器可能需要單獨的説明。Allotrope正在開發旨在與設備無關的標準,使使用不同設備的科學家能夠無縫合作。設備製造商正在開發針對他們銷售的設備優化的專有系統。Thermo Fisher Scientific提供一個網絡平台,用於上傳數據並使用一套應用程序進行分析,並能夠通過智能手機遠程監控實驗。目標是“消除當前拼湊的數據分析中的低效,”Thermo Fisher的首席信息官Joe Beery説。“研究人員只想要答案。”
倫敦初創公司Synthace尋求通過其稱之為實驗室設備操作系統的系統促進溝通。該系統名為Antha,允許科學家指定他們試圖研究的內容,建議實驗,並控制實驗室硬件,在必要時暫停以提示人類,例如插入新的液體樣本板。實驗步驟和數據以通用格式記錄。Synthace為大約10家制造商的十幾種設備開發了“驅動程序”,這些製造商包括羅氏和珀金埃爾默。
Synthace的Antha實驗室設備操作系統。
最終,Synthace表示,Antha的使用可能會普及到足夠的程度,以至於與該系統的兼容性將成為設備的一個賣點,鼓勵製造商自行創建驅動程序。該公司在十月宣佈與默克(與默克KGaA無關)建立合作關係,並正在與另外四家主要製藥公司談判,將Antha引入他們的實驗室。道化學正在使用Antha設計農作物化學品。Synthace的聯合創始人、 biochemist和首席科學官Markus Gershater説:“我花了大約五年的時間與計算機程序員合作,意識到他們擁有比許多科學家更復雜的工具。‘這不是硬件問題——硬件很棒。這是一個軟件問題。”——與**Doni Bloomfield
***底線:***設備製造商和初創公司正在競相通過使實驗室設備能夠互相通信來簡化科學研究。