實驗記錄到底怎麼記?_風聞
返朴-返朴官方账号-关注返朴(ID:fanpu2019),阅读更多!2019-11-07 10:02
Science Career | How to keep a lab notebook
作者**| Elisabeth Pain**
編譯**| 麥田**
Cultura Creative (RF) / Alamy Stock Photo
我把那張紙放哪了?我什麼時候做的這個實驗?我把數據文件存哪去了?如果你發現自己經常要從實驗時草草記下的筆記裏找一個重要的實驗細節,或者試圖回憶起什麼時候做了什麼實驗,又或者搜遍了你的硬盤才找到想要的文件,也許你是時候需要重新考慮一下怎樣寫實驗記錄了。不管你是在實驗室、地裏還是做理論研究的,你都需要做好記錄,清清楚楚地記錄下來你做了什麼,這樣你或者其他人才能夠返回來查閲,如果需要的話。
其實除了傳統的紙質版的實驗記錄,還有很多工具能夠幫助科學家們記錄工作和進展,但到底如何記錄才最有效,有沒有什麼好的方法,卻很少會有人教你。許多科研機構、組織都有關於實驗記錄的要求或指南,但在保證遵守這些規定之外,其實你可以自由發揮,按照自己的喜好來,找到最合適最有效的方式。Science Careers走訪了來自不同學科、處於不同事業階段的科研工作者們,在這裏和大家一起分享他們記實驗記錄的竅門和策略。為了保持內容短小精悍,回答內容已稍作修改。
實驗記錄是件麻煩事,為什麼還要花時間精力去做呢?
每天寫實驗記錄就像看牙醫,沒人願意去,但你不去牙又會壞。實驗記錄是你每天在實驗室創造的最有價值的財富,一份好的實驗記錄還真的需要每天花點功夫。一旦你養成了習慣,有了自己喜歡的模式,寫實驗記錄也就不那麼麻煩了。
——Caroline Bartman,普林斯頓大學定量代謝組學博士後
我的實驗記錄本裏清楚地記錄了我所有的實驗過程、失敗經驗還有體系優化,這是保持嚴謹和可重複性的非常重要的工具。如果我忘了我怎麼做的實驗或者怎麼分析的數據,我都可以在實驗記錄本裏查到,而且還能幫助以後需要做類似實驗的同學,他們可以作為參考並知道我已經試過哪些條件了。
——Maiko Kitaoka,加州大學伯克利分校分子和細胞生物學博士生
勤奮地記錄下每天的實驗過程可以幫我理解某些結果,詳細記錄有時會幫上我的大忙,讓我意識到某天的結果異常很有可能是環境因素比如當天的温度變化導致的。久而久之,我的實驗記錄本還成了我記錄想法的地方。你肯定不想實驗中間突然去改實驗設置或者方法,但你的實驗記錄本正是設想下一步如何改動的完美之地。
——Valentina Ferro,實驗物理學博士,在華盛頓西雅圖任自由科學插畫師
對於搞理論研究的我來説,記錄本非常非常必要,我可以記錄下我解決問題的過程。如果不好好記錄,我很有可能會重複計算很多次,而且記錄本還可以方便我和合作者分享方法和結果。
——Matteo Falessi,意大利ENEA弗拉斯卡蒂研究中心等離子物理方向博士後
如果沒有詳細的實驗記錄,想要追溯之前的數據就像考古一樣,而一份詳盡的實驗記錄可以幫你快速地瞭解之前出於什麼目的做了哪些實驗,重新審視原來的數據並發現新的亮點,或者幫你重拾之前的工作。更高層次上來講,一份好的實驗記錄可以保證實驗的可重複性,證明實驗是按照清晰的邏輯順序操作並且符合倫理規範的,或者證明為什麼實驗需要如此設計。
——Caroline Lynn Kamerlin,瑞典烏普薩拉大學結構生物學教授
如果你是在實驗完成幾個月甚至幾年後寫文章,實驗記錄本則包括了用來寫方法和結果的所有細節。在你職業生涯的某些階段,你可能需要提供證據來證明某個想法真的是你首先提出的或者你擁有某項知識產權。此外,如果面臨學術不端的控告,你的實驗記錄本將是強有力的證據。總之,實驗記錄本就像是職業生涯的賬本,也是你作為科學家的財富,千萬不要忽略它!
——Jeremy C. Borniger,加州帕羅奧多市斯坦福大學神經科學方向博士後
你是用傳統紙質的記錄本,還是電子版,還是都有?
我喜歡用紙質的記錄本,儘管我產生的大部分數據都是電子版的,我還會偶爾在文檔裏記錄下技術細節,比如顯微鏡的拍照參數、哪些實驗結果合在了一張圖裏,這樣我就能方便地找到,但傳統的紙質記錄本最大的缺點就是不好搜索,所以我會把記錄本的前幾頁列成目錄,還會經常交叉參照我的電子數據文檔。
——Kitaoka
我覺得電子版的實驗記錄比紙質版好太多了,搜索很方便,可以輕易地調取幾年前的實驗記錄或者梳理一遍找到關鍵細節;也不會因為不小心打翻酒精而毀掉;只要你備好份就不會丟,而且需要脱掉手套在電腦前寫,所以也能強迫我騰出專門的時間用心來寫。
——Bartman
在我剛開始科研事業的時候我都是用紙質版的記錄本,但後來我調整了我的策略,因為我完全迷失在那些頁碼裏。現在我只在做實驗的時候在紙質記錄本快速記下一些點,所有優化後的實驗步驟、原始數據和分析結果都存在電腦裏,我會分別利用筆記本上的日期標註和簡短的實驗描述來交叉參考紙質版和電子版的實驗記錄。此外,我發現另起一本記錄本來記一些更加寬泛的事情非常有用,比如將實驗概念化、起草初稿、組織會議或者記會議筆記等。
——Karine Salin,法國IFREMER環境生理學方向研究員
我在紙質版上更容易產生新的想法,所以一開始我只用紙質版的實驗記錄本,但我同時做好幾個項目,需要很方便地查到每個項目才行,所以我現在喜歡用電子版記錄本比如Evernote,可以添加紙質筆記的快照、編寫腳本和其它電子版的文件、圖片,而且可以在手機上裝上APP,這樣如果我在走路的時候突然有了好的實驗想法就可以立即把語音錄下來。但是電子版記錄也有缺點,如果你忘了是什麼內容,翻一下紙質的記錄可能就找到了,但在電子版記錄裏你可能根本不知道應該搜什麼。我後來克服了這一問題,記筆記的時候我會加上“自由”標籤,記下任何似乎跟實驗不太相關的想法和未來可以探索的問題,時不時地回顧一下,激發我的靈感。
——Ferro
通常,紙質版的記錄本就足夠了,但我會把所有的筆記做電子備份,要麼用Genius Scan軟件拍照,要麼寫到word文檔裏。我還會在電腦裏建一個文件夾,存着所有的實驗步驟,這樣每次做實驗的時候查看起來很方便,也不用每次都在實驗記錄本上寫一遍。此外,我會給每個科研項目準備一個活頁夾,外面寫上標籤,裏面放着一些不方便放在實驗記錄本裏的東西,比如説excel表打印件、圖表數據、合同和材料轉讓協議。
——Borniger
我在Org-mode上記筆記,這是一種針對簡單插入各種手寫材料如結果、計算過程、公式、表格、參考書目甚至代碼而專門設計的標記語言,筆記本身有鏈接的純文本文件,所以當我需要寫文章的時候我可以直接把這些文本文件轉成LaTeX文件就能作為初稿。
——Falessi
我主要用電子版筆記,但在實驗室的時候我會先寫在本上,千萬不要隨便拿張紙,然後我會把紙質的記錄本掃描保存,這樣我就可以隨時隨地查看了。我用Confluence作電子記錄,但微軟的OneNote也非常好用,因為脱機或者聯網都可以用而且軟件也是免費的。我會利用紙質版筆記的頁碼和電子版文檔的日期、實驗名稱來交叉參考。所有的實驗步驟我都會存成電子版,包括實驗設置、材料、儀器的照片,有時我還會錄下自己描述整個實驗步驟的視頻。我的原始數據會存在實驗室的服務器上,在雲端或者硬盤上備份;處理分析數據的代碼會存在Github上,一個很有名的軟件項目託管系統;我還會在電子版實驗記錄上列出要做的事情,這樣順便也可以幫我記錄我每週都做了什麼。
——Lina Colucci,劍橋市麻省理工學院健康科學和技術方向助理研究員,舊金山灣區數據諮詢師
你會採取什麼策略來保證實驗記錄有條理、完整並且實用呢?
我的策略就是要把記筆記作為一步重要的實驗步驟。我通常會邊做實驗邊寫,偶爾會在實驗前寫好步驟或者我要做的幾點,然後實際做的過程中如果有變動的地方我會記錄下來,所以記實驗記錄其實像做飯一樣,在做飯的同時收拾總比等盤子堆到天花板了再收拾好得多。儘早記筆記還可以防止遺漏重要信息或者引入錯誤。
至於條理性,我就是簡單地按照時間順序來記錄,所以每頁都是新的一天(除非當天有很多頁)。我會寫得非常詳細,我做了什麼、為什麼這麼做、怎麼做的、日期、時間、地點、和誰一起、有無特殊環境(比如火災警報是否可能影響實驗結果)和我的簽名,甚至可以的話會讓在場的人簽名(我的導師或者實驗室的夥伴)。所有這些都要用鋼筆清晰地記錄在本子上,即使寫錯了也不要塗掉,把寫錯的地方劃掉,這樣就能看到原來的字跡。你還可以在本子上記下你的想法,這也是可以的,其實也是應該被鼓勵的
——Borniger
在我的實驗記錄本裏,每個實驗都是連續的幾頁,因為如果幾個實驗混着記錄會變得非常難找。如果我同時做了好幾個實驗,我會給每個實驗留出空白頁,這樣每個實驗的步驟和筆記就是連續的,需要一連做好幾天的實驗也是如此。細節決定了記錄的好壞,所以我會盡量簡潔,但始終要保證儘可能把相關細節都記錄下來。
——Kitaoka
我對我的學生説過他們不必按照統一的格式來記筆記,只要他們寫的夠詳細,自己容易找到就可以,但我會要求他們在做之前儘可能把能寫的都寫下來,然後在做實驗的過程中指導他們學會記錄,因為他們經常會不小心跳過一步或沒按步驟的順序做,所以記錄下來很重要。剛開始的時候你可能需要在筆記本上寫很多,包括如何設置、如何操作的,但有經驗了以後再做,你就只需要記下改動的變量就可以了。永遠都不要到處亂記然後事後又抄到一起,這樣難免會丟掉一些信息。
——Danielle Solano,貝克爾斯菲市加利福尼亞州立大學化學與生物化學系主任、副教授
記實驗筆記最難的地方在於決定什麼時候詳細地寫,什麼時候可以粗略地寫。我一般會先寫得相對簡單一些,記下實驗的日期、時間、地點、參數、數據存放的位置或者如果我用到代碼的話,還要記下腳本的名稱和Github編號。隨後,如果我發現這個實驗還沒完成,我會寫一份更長的報告記錄下此次實驗的目的、假設、數據收集的日期、數據鏈接、分析腳本、數據收集當天的筆記、完整的實驗步驟、實驗設置的圖片記錄或者視頻記錄、結果結論以及下一步計劃。
我的實驗記錄是按時間順序寫的,每頁都有日期,我還會標出實驗地點和筆記。如果我在本子裏粘了些東西,我會在旁邊簽上名字和日期。如果我哪天改動了一些內容,我也會在旁邊簽名並寫上改動的日期。對於電子版的實驗記錄,我設置了每天自動備份。
——Colucci
每天開始實驗的時候,我會在Evernote上新建一頁筆記,寫好日期,然後把一天的過程開始往上添加,紙質版的筆記會拍快照上傳,隨後在APP上整理。每天收工的時候,我會花15分鐘過一遍當天的筆記,如果有因為寫的太快而不合適的詞就改一下,如果還有其他的圖片和分析都添上,再加上一些感想,最後給當天的筆記加個合適的標籤。
——Ferro
我的記錄本裏有兩部分內容非常重要,一個是做過幾次實驗之後自己整理完善後的實驗步驟,另一個是實驗過程記錄。關於後者,我會在做的過程中把要點和觀察到的東西先寫在便條紙上,然後再在電子版的記錄裏按照條理寫下來。本身做完實驗之後可能就很累了,這時候還要記筆記着實很煩人,但這的的確確是最重要的一步。如果我實在要拖到明天,我會在桌上專門清出一片地方,放好我的筆記,這樣第二天我一來就可以更新實驗記錄了。
——Bartman
其他建議?
我強烈建議大家在科研生涯的初期勇於嘗試,試驗一番你才能最終找到最適合自己的記錄方式。好的記錄方式應該簡單方便、易於備份,説到這,其實沒有任何一種方式會是完美的,所以你需要多嘗試,但最好別超過三到四種。我通過一段痛苦的經歷意識到了這一點,如果你用的工具太多,你的數據會異常分散,當你需要查找的時候自己都找不到。
——Colucci
在我看了實驗室之前成員的實驗記錄本之後,我發現除了實驗步驟和犯錯經驗,還有一些內容也是應該記下的,而且語言描述的準確、詳略程度直接決定了後續是否容易重複出來這個實驗,如果缺少細節的話會很愁人,所以我會格外注意,希望後續實驗會盡量順利一些。
——Kitaoka
只要你不違反規則,按照自己的方式行事完全沒有問題。我之前呆過的一個研究所就有自己的要求,但是我更喜歡我自己的方式,所以我還是用我原有的方式,然後每週把我的工作記錄變成他們要求的格式。雖然看上去增加了工作量,但我寧願這麼做,要不然我就沒法保證連續記錄,對我自己、我的實驗室甚至研究所來説都是嚴重的損失。
每天都要記錄做了什麼看上去很瑣碎,但也可以幫你調節心情。科研項目總是起起伏伏,可能低谷的時候還更多,有時感覺沮喪無助也是家常便飯,回頭翻一翻記錄本還能讓你全面審視一遍,意識到自己其實已經做了很多。
——Ferro
比起做實驗,記筆記總是容易被忽視,但它真的真的很重要,尤其是供你歸類、查閲信息。養成好的習慣什麼時候都不晚,所以,請重新考慮一下你記實驗記錄的方式吧。如果你需要改變,請從今天就開始做起!
——Kamerlin
本文經授權轉載自微信公眾號“BioArt植物”,原文鏈接:doi:10.1126/science.caredit.aaz3678。
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