世界首個野生梨基因組圖譜完成

本報訊(記者黃哲雯)記者獲悉，中國農科院果樹研究所研究員曹玉芬團隊與中國科學院遺傳與發育生物學研究所研究員田誌喜團隊,日前合作組裝了高質量的杜梨參考基因組序列——這是世界首個野生梨的基因組圖譜，也是我國在梨基因組學研究領域又一重大研究進展。

該基因組的公佈豐富了梨屬植物基因組信息，同時將為梨基因組研究、功能基因挖掘、梨屬植物馴化以及野生資源利用提供重要保障。

據曹玉芬團隊介紹，科研人員以山西杜梨為材料，結合PacBio三代測序、Bionano光學圖譜、Hi-C技術，組裝了高質量的杜梨參考基因組序列。具體來看，杜梨基因組組裝大小為532.7兆，contig N50為1.57兆，共有59552個蛋白質編碼基因和247.4兆重複序列被註釋，通過BUSCO對基因組完整性進行評估，完整性達到95.9%。

研究認為，杜梨擴張基因在次生代謝通路中顯著富集，可能進而影響杜梨較強的逆境適應性。分析結果顯示，馴化過程中，東方梨的果實大小、糖代謝和轉運，以及光合效率受到正向選擇。

研究同時發現，梨屬植物在馴化過程中果實酸澀味逐漸消失。杜梨原花青素合成結構基因拷貝數顯著多於白梨，影響了原花青素的積累，同時花青素還原酶代謝途徑是原花青素合成的唯一途徑，山梨醇轉運蛋白跨膜轉運可能是影響可溶性有機物質積累的主要因素。