華為雲聯合上海營養與健康研究所、上海巴斯德所，推出新冠病毒基因自動化鑑定雲平台_風聞

來源：中科院官網  新型冠狀病毒專題知識服務與科研攻關交流平台  時間：2020.02.10

原文網址：http://ncov.scholarin.cn/resources/report/841f74884b59944ab97f249f61ed5fee

       2月8日，中國科學院上海營養與健康研究所、中國科學院上海巴斯德研究所共同開發，華為提供雲計算技術支撐的病毒基因組自動化鑑定平台（VirusIdentificationCloud,VIC）在華為雲正式上線。該平台直接對接人體樣本的RNA二代測序原始數據，具有對數據全自動質量控制、拼接和病毒組成分析等功能，實現了快速檢測樣本中可能存在的包括新型冠狀病毒在內的各種病毒，並在線分析其相對載量。

      基因組測序是新型冠狀病毒疑似病例確診的病原學證據之一，國家衞健委發佈的《新型冠狀病毒感染的肺炎診療方案（試行第五版）》還要求對鑑別診斷的要求“單從臨牀表現、胸部影像學難以鑑別，需依靠病原學檢測來區分。”基於基因組分析結果，可精準識別病毒基因特性，監測病毒變異趨勢，在疫情防控、疾病診治、藥物篩選、疫苗設計與藥物研發等工作中發揮着不可替代的基礎性的作用；也將支撐病毒朔源、變異進化、致病機理等研究工作。

      VIC平台實現了從病毒組基因組測序到基因組拼接與鑑定的“一鍵式”自動化服務，極大簡化了操作流程。各醫院只需上傳病例原始數據至華為雲，即可觸發病毒基因分析流程，並獲得該病例的全基因組分析結果。VIC得到華為雲容器平台強大計算能力的支持，可提供高通量多樣本並行雲端分析能力。分析結果不僅能為全面分析研究患者的呼吸道病毒組，研究其致病因子提供支撐，亦可助力臨牀診斷，為採用相應的治療措施提供參考，同時還可監測病毒變異趨勢，便於提前做出應對措施。

      VIC由中國科學院上海巴斯德研究所大數據平台設計，由中國科學院上海營養與健康研究所生物醫學大數據中心開發、運維並提供技術支撐，由華為雲基因容器提供算力支撐。在疫情結束前，VIC面向全國用户免費開放，目前，上海市公共衞生臨牀中心，上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院、中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院作為平台的首批用户，已在VIC上完成了批量新型冠狀病毒肺炎患者樣本的基因組原始測序數據分析。

      平台的服務網址是http://vic.biosino.org/vic/和http://hvic.biosino.org/vic/