中醫藥證候關聯數據庫SymMap：一篇10分+的大文章_風聞
星期一到星期天-每天一个都新鲜2020-06-19 19:25
這麼好的數據庫居然今天才知道，學習一下！
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一、數據庫簡介
SymMap（Symptom Mapping）是一箇中醫藥證候關聯數據庫。數據庫於2018年8月發表於核酸研究雜誌（NucleicAcids Research）。該數據庫收錄了2015版中國藥典包含的499種草藥以及對應的1717箇中醫證候，並將中醫症狀對應到961個西醫症狀，同時收錄了5235個與這些證候關聯的疾病、19595個草藥成分、4302個藥物靶點，以及這六種類型的數據之間的關聯關係。SymMap通過這種方式將中國傳統醫學與現代醫學從表型到分子層面加以關聯。
下表列出了數據庫中數據的來源。
下圖是SymMap數據構架及數據關係圖。中間是SymMap中包括的六類數據：草藥、成分、靶標、疾病、中醫證候、現代醫學症狀。左側是數據庫包含的六類數據間的直接關聯關係：草藥-中醫證候關聯關係6338對、草藥-成分關係48372對、中醫證候-西醫症狀關聯關係2978對、成分-靶標關係29370對、靶標-疾病關係7256對、西醫症狀-疾病關係12107對。右側列出了數據庫包含的數據之間的9種間接關聯關係及其數量。
二、草藥查詢
以黃連為例，介紹草藥信息查詢。查詢步驟見下圖。
在下一個頁面獲得草藥的藥性、藥味、歸經信息。
這個頁面往下拉，是這個草藥的草藥-中醫證候-西醫症狀-成分-靶標-疾病關聯網絡，此網絡可下載。
再往下拉，是草藥與其它5類數據的關聯關係列表。首先選擇查看與其中某一類數據的關聯關係，例如下圖選擇查看與中醫症狀的關係。接着，可以選擇按不同程度的統計分析結果來呈現，點select右邊的框，可以選擇查看所有，或者按照p值或fdr值查看結果。最後點擊“download”按鈕可以下載關聯列表。
查詢該草藥的成分和對應靶標方法見下圖：
三、查詢其它數據
同理，在查詢頁面，可以分別以中醫證候、西醫症狀、成分、靶標、疾病為關鍵詞查詢，不再贅述。
參考文獻：
Wu Y, Zhang F, Yang K, Fang S, Bu D, Li H,Sun L, Hu H, Gao K, Wang W et al: SymMap: an integrative database oftraditional Chinese medicine enhanced by symptom mapping. Nucleic Acids Res2019, 47(D1):D1110-d1117.
這個數據庫發了一篇10分的文章，厲害了，我也想發大文章！