西班牙在去年3月廢水樣本中檢出新冠病毒,這個研究靠譜嗎?_風聞
今天敲钟人不来-2020-06-28 15:55
來源 | 科研大匠(keyandajiang)
6月26日,西班牙巴塞羅那大學發佈公告稱,該校領導的一個研究小組在2019年3月採集的巴塞羅那廢水樣本中檢測出新冠病毒。
**這項新研究結果挑戰了目前關於新冠病毒起源和時間的共識。**公告出來後,在業內引起了巨大爭議,也吸引了世界各大媒體的廣泛關注。
公告稱,巴塞羅那大學腸道病毒小組的研究人員對當地廢水樣本做了檢測,結果發現在2019年3月12日採集的廢水中已有新冠病毒的蹤跡,此前該小組的研究人員已在2020年1月15日的廢水樣本中檢測到了新冠病毒的存在。而西班牙本土直到今年2月25日才報告首例新冠確診病例。
巴塞羅那大學公告的這項研究,由該校生物學教授Albert Bosch領導,該研究結果已經於6月13日發表在未經同行評審的預印本網站medRxiv上。研究題為“Sentinel surveillance of SARS-CoV-2 in wastewater anticipates the occurrence of COVID-19 cases”。
Albert Bosch教授稱,研究小組檢查了2018和2019年的廢水樣本,目前僅有2019年3月12日的樣本聚合酶鏈式反應(PCR)檢測呈陽性,且病毒水平非常低,其他所有樣本的檢測結果均為陰性。他認為,巴塞羅那旅遊業發達,遊客眾多,這一研究結果表明世界其他地區很可能也發生了類似情況,但許多病例或因被誤診為流感病例而被掩蓋。
為分析西班牙SARS-CoV-2的存在情況,研究人員對巴塞羅那的兩個大型污水處理廠(WWTP1和 WWTP2)的24小時複合污水樣本進行了檢測分析。
在分析WWTP2 2019年12月至2020年5月的時間段樣本發現了一個出乎意料的結果,分析表明:在2020年1月15日至3月4日樣本中,新冠病毒的基因組就在不斷增加,更值得注意的是,巴塞羅那宣佈第一例新冠病例(2月25日)前41天(1月15日)在污水中就能檢測到新冠病毒了,研究者認為,這證明廢水監測能夠有效地預測新冠病例的人口規模。
具體檢測方法:通過用20%聚乙二醇6000沉澱將800毫升廢水樣品濃縮,並重懸於3毫升pH 7.4的PBS中, 從1毫升濃縮物中進行核酸提取,並使用提取系統以50微升洗脱。研究方案採取實時RT-PCR檢測新冠病毒。
對於廢水監測預測新冠病例的人口規模**,Nature曾發文梳理:**
Nature:生活廢水中也檢測出冠狀病毒,或可據此推測出包括無症輕症新冠患者真實感染規模,還可提前7-10天發出預警
於是,研究組冰凍保存的WWTP2樣本進行了檢測,在對WWTP2 2018年(1月至3月)、2019年(1月、3月、9月至12月)和2020年(1月至3月)的冷凍污水樣品進行檢測分析後,有了驚人發現:
檢測結果顯示,在2019年3月12日的樣本中, IP2和IP4靶點檢測均呈陽性。
不過,對於該研究,有專業人士評論稱:該研究樣本污染機會比較多。研究中使用800克的污水加聚乙二醇6000獲得沉澱,然後溶解為3毫升。**濃縮步驟不規範。**用的是製備技術,而不是微量分析技術的樣品濃縮方法。**應該用膜吸附的方法濃縮,**這裏的層析膜是經過驗證的,沒有任何污染,而且很容易做好空白對照實驗。
多位專家也指出:研究人員應該公佈測得的基因序列,這樣才可以比對出病毒演化位置。
還有人提出一個疑點:為何僅在2019年3月12日的樣本中檢測到弱陽性,3月份以後都消失了?
“現在下結論還為時過早,有可能是假陽性。”
對於該研究,西班牙公共衞生局Joan Ramon Villalbi博士表示:
“目前只看到一個結果,我們需要參照更多的數據、研究和樣本來證實它,並排除實驗室錯誤或方法漏洞問題。”
參考信息:
1.https://www.ub.edu/web/ub/ca/menu_eines/noticies/2020/06/04html
2.https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.06.13.20129627v1.article-info
本文編譯自巴塞羅那大學,nature,medrxiv等、僅用於學術分享