《自然》:香港男子二次感染冠狀病毒,基因測序已證實!_風聞
推医汇-汇聚健康行业资讯,推动学术交流。2020-08-27 17:46
8月中旬,一名從西班牙返回香港的33歲男子,在通過香港機場的篩查和測試檢測中感染冠狀病毒,據瞭解,該男子第一次出現輕微症狀,第二次沒有症狀。香港大學(University of Hong Kong)的科學家認為,他們找到了有人再次感染COVID-19病毒的首個證據。

8月25日,《自然》報道這項病例情況,題為“Coronavirus research updates: Reinfection with SAR-CoV-2 is confirmed for the first time with genetic evidence”.

文章指出,COVID-19的關鍵問題之一:能否發生真正的二次感染?近期研究表明,抗體滴度早在急性感染後1-2個月就開始下降。一例病例報告提示可再次感染,但未進行病毒基因組分析。報告的病例引起了持續病毒脱落和再次感染之間的爭議。
研究人員指出,病人第二次感染髮作,發生在第一次發作後的4.5個月。並使用全基因組分析來區分再次感染和持續病毒脱落,這得到了流行病學、臨牀和血清學數據的支持。
患者在第一次發作時,他出現咳嗽和痰,喉嚨痛,發燒和頭痛3天。2020年3月26日經口咽後唾液SARS-CoV-2 RT-PCR陽性確診,於2020年3月29日住院。之後,他所有的症狀都消失了。2020年4月14日患者出院,經鼻咽拭子和咽喉拭子兩次RT-PCR檢測均為陰性,檢測時間為24小時。
在新冠肺炎第二次無症狀發作期間,患者從西班牙經英國返港,於2020年8月15日在香港機場進行入境篩查時採集的口咽部唾液經SARS-CoV-2 RT-PCR檢測陽性。他再次住院之後,一直是無症狀。他的體温為36.5 c,脈搏每分鐘86次,血壓為133/94,體檢結果不顯著。住院時口咽後唾液Ct值為26.69。入院時,CRP水平在8.6 mg/L時略有升高,但在住院期間下降。有低鉀血癥,但其他血液檢測結果正常。連續的胸片沒有發現異常。在住院期間,口咽後唾液的實時RT-PCR Ct值逐漸下降,表明病毒載量減少。
再次感染時c反應蛋白水平、病毒載量(Ct值)和SARS-CoV-2 IgG結果
第二次住院時的血液檢查結果
第一次發病後10天和第二次住院後1天收集的血清標本檢測IgG抗SARS-CoV2核蛋白,呈陰性。從3月第1期和8月第2期採集的口咽後唾液標本進行全基因組測序分析,分析表明,第一個病毒基因組與第二個病毒基因組屬於不同的譜系(圖2)。第一個病毒基因組屬於GISAID clade V、Nextstrain clade 19A和穿山甲B.2。第二個病毒基因組屬於GISAID-G,Nextstrain-20A和穿山甲B.1.79。除了ORF8的64位有一個終止密碼子,是導致第一次感染的病毒基因組中58個氨基酸被截斷,這兩個病毒基因組還存在另外23個核苷酸的差異。兩個基因組之間的氨基酸分別位於棘狀蛋白和輔助蛋白。

我們對第一個和第二個基因組進行了快速搜索。第一個病毒基因組與2020年3月和4月從美國或英國採集的毒株關係最為密切。第二個病毒基因組與2020年7月和8月從瑞士和英國採集的毒株關係最為密切。第二個基因組包含突變nsp6 L142F,這是很少發現的。
有幾條證據支持第二次發作與再次感染有關,而不是病毒的持續釋放。首先,全基因組分析表明,第一、二期SARS-CoV-2株屬於不同的支系/譜系,有24個核苷酸差異,説明第二期檢測到的病毒株與第一期發現的病毒株完全不同。第二,患者CRP升高,病毒載量逐漸下降,SARS-CoV-2 IgG在第二次發作時血清轉化,表明這是一次真正的急性感染。第三,在第一次和第二次發作之間有142天的間隔。先前的研究表明,對於大多數患者來説,在症狀出現一個月後,病毒RNA是無法檢測到的。
據報道,病毒持續脱落有超過一個月的,但這種現象畢竟是少數。一份報告中,一名孕婦在最初的陽性試驗後104天內檢測出病毒。第四,病人最近去了歐洲,自2020年7月下旬以來,COVID-19病例有再次出現。然而,第二次發作期間獲得的病毒基因組與7月和8月從歐洲採集的毒株在系統遺傳學上密切相關。
再次感染的確認有幾個重要意義:
羣體免疫不太可能消除SARS-CoV-2;
COVID-19可能會像其他冠狀病毒一樣,繼續在人羣中傳播;
季節性冠狀病毒(229E、OC43、NL63和HKU1)再感染常見;
在某些情況下,即使特定抗體處於穩定水平,也會再次感染;
疫苗可能無法提供針對COVID-19的終生保護,疫苗研究還應包括從COVID-19中康復的患者。
在SARS-CoV-2感染期間,大多數患者產生中和抗體。在我們的患者中,雖然抗SARS-CoV-2抗體在第二次發作初期未檢出,但殘留的低效價抗體可能部分控制了病毒。由於中和抗體以刺突蛋白為靶點,因此刺突蛋白的變化可能使病毒對第一次感染時誘導的中和抗體不那麼敏感。
對於我們的患者,在第一次和第二次感染的刺突蛋白中有四個氨基酸殘基不同,包括L18F、A222V、D614G和Q780E。D614G,在大多數SARS-CoV-2毒株中發現,研究表明D614G增強了SARS-CoV-2複製。從COVID-19患者中恢復的康復期血清中,有7%對614G的血清中和活性降低, 需要進一步的血清學研究以確定第一次感染和第二次感染之間,SARS-CoV-2刺突蛋白中的這些氨基酸差異是否造成了再次感染。
T細胞免疫也可能在再感染中發揮作用
冠狀病毒可以誘導長期的T細胞免疫,T細胞免疫主要針對刺突蛋白,但CD4/CD8+ T細胞對其他病毒蛋白也有反應。CD4+ T細胞靶向nsp3、nsp4和ORF8,而CD8+ T細胞靶向nsp6、ORF3a和ORF8。在早期感染幾個月內,恢復的COVID-19患者可檢測到T細胞免疫。其中一個氨基酸變化位於刺突蛋白氨基酸殘基222,這也是引起CD4+ T細胞反應的潛在位點。
此外,研究人員發現:抗SARS-CoV-2的IgG在第二次發作診斷後不久採集的血液中檢測不到。抗體水平低可能與首發時病情輕微有關。我們和其他人已經證明,病情較輕的患者的抗體滴度比病情嚴重的患者低。
本研究存在一些侷限性。首先,研究人員只收集了一份首發病例的血清標本。第二,使用來自兩次發病的上呼吸道標本的病毒培養仍在進行中,因此不能比較第一次和第二次發病對病毒的中和抗體滴度。
總之,在首次出現症狀性感染4.5個月後,再感染是可能的。只是一次感染的人羣應考慮接種疫苗有COVID-19感染史的人,應採取戴口罩和保持社交。
一位專家認為這份報告是個好消息。費城兒童醫院的疫苗專家Paul Offit博士在接受《美國醫學會雜誌》的採訪時説,“就我而言,這是一個勝利,因為這表明第一次感染可能會保護一個人第二次不患中度至重度疾病。”
5月中旬,醫生信息共享網站Sermo進行的一項調查發現,在4173名醫生中,13%的人認為他們曾經治療過一名或多名再次感染的患者。此外,在受訪者中,7%的美國人和16%的其他國家的受訪者認為他們見過這種情況。
參考資料:
1. https://www.nature.com/articles/d41586-020-00502-w
2.https://medicalxpress.com/news/2020-08-scientists-hong-kong-coronavirus.html
來源:生物谷