在病房外攔“妖怪”的人_風聞
显微故事-显微故事官方账号-大时代下,每一个小人物都不普通。2021-03-30 14:26
人類為什麼要仰望星空?
羅帥的答案是:“為了讓身邊的人過得更好一些。”
本期顯微故事講述的是一羣從事基因檢測行業的人。他們希望藉助基因檢測,為人們預告患病風險,提供健康管理建議,在病魔這隻“妖怪”進入病房前,就攔住它。
以下是關於他們的真實故事:
文 | 趙然
編輯 | 梅子
病房裏的“妖怪”
病人的每一口呼吸吐納都已是煎熬,非小細胞型肺癌帶來的巨痛無時無刻不在折磨着他。
基因檢測實驗室裏,羅帥的目光正停留在病人的肺穿刺樣本上。
樣本的檢測、分析已藉助高通量測序儀完成了大半,只差最後一個環節,基因檢測報告就能和血檢結果一起,為治療方案提供用藥指導了!
實驗突然被打斷,羅帥收到醫院通知:暫停實驗。
北京的夏天燥熱沉悶,白大褂下,一股涼意從腳底躥起——這意味着,病人已經去世了。
他曾做過上千例活檢樣本的基因分析,這是最懊惱的一例。
非小細胞肺癌彷彿一個“妖怪”,所有肺癌裏,80%都是它的身影。其中,近7成患者發現時已處於中晚期,而這個“妖怪”最主要的致病因素就是吸煙。
“真的很遺憾沒能挽救,如果能提前預防該多好。”
羅帥不想再在病房裏捉“妖怪”了,他想在“妖怪”進入病房之前,就攔住它。
幾千萬年前的秘密
2019年初春,寒意料峭,羅帥走進北京二環建國門外的一處共享辦公空間,坐在了李智面前。
李智的上一個身份是年薪幾百萬的某私募基金副總裁,在進入投行之前,他的人生軌跡更多和生命科學研究有關。
2005年,李智進入武漢大學生命科學院讀本科時,中國的基因檢測行業剛起步。
那時,全球多國耗資30億美元的人類基因組測序工作終於完成——1700萬年前,人科從長臂猿科的祖先中分離出來,從古老的時光就鐫刻進基因雙螺旋60億個鹼基裏的秘密,第一次在人們驚奇的注視中緩緩展開。
當時,社會上已經流行“21世紀是生命科學的時代”這一説法,但李智就讀的生命科學專業待遇並不與名氣成正比。
**“國內生命科學專業博士每月才拿1000元左右的薪水”,**李智認為,本質上是生命科學的產業化程度較低。
2014年,李智尚在投行時,基因檢測行業的轉折點已悄然來臨——基因檢測公司Illumina發佈了新款基因測序儀HiSep x Ten,可以準確測出全基因組序列,並將基因測序成本降到千元美元的水平,基因檢測的市場開始迎來全面爆發。
隨着成本的下降與技術的普及,基因檢測的概念也逐漸深入人心。
一個廣為人知的例子是,好萊塢女星安吉麗娜·朱莉在38歲時,發現自己攜帶了高危的乳腺癌基因突變,於是做了雙側乳腺切除手術。
Illumina採用的基因測序法是“鳥槍法”測序,有點像拼圖遊戲,基於完整的人類基因圖譜這個封面,先將所有基因組打亂,切成隨機碎片,然後測定每個小片段的序列,最後像對照拼圖封面那樣,重新排序切片,確定它們在基因組中的正確位置。
聽起來簡單,但實際的測序困難程度好比從一座堆滿了拼圖碎片的大山裏,準確無誤地拼一幅圖出來。李智清楚,對於基因的解讀不僅需要生命科學的創新,更對雲計算有着天然的需求:雲計算出現前,基因數據分析需要長達數月的計算週期,雲計算極大地加快了基因數據分析速度;基因檢測先拆分小片段,再分段得出結果,最後合併結果,好比大數據中的並行計算。
**“基因測序探索着從生命誕生之初至今的密碼,雲計算是思考者,把探索者發掘的每個蛛絲馬跡,變成對生命未來衍變的預言。”**李智説。
他敏鋭地捕捉到基因檢測技術的進步和成本的下降,想讓普通消費者也能夠享受到這項技術帶來的好處,於是辭職創立了北京拉索生物科技有限公司(以下簡稱“拉索”)。
基因檢測有兩個方向,一個是醫療級基因檢測,如羅帥之前的工作,包括生殖健康、腫瘤診斷及治療等領域,價格動輒上萬;另一種是消費級基因檢測,為普通消費者提供泛醫療領域的藥物反應檢測、遺傳病風險檢測、健康風險評估、用藥風險提示等,給出健康管理建議,幾十元到幾百元的價格也更親民。
李智選擇了後者,從西裝革履的投行精英,變成了在知乎上熟練地回複基因檢測相關問題的創業者;羅帥則抱着**“把患病風險提前告知人們,通過改變生活習慣減少患病幾率”**的想法,成為拉索的一名遺傳諮詢師。
圖 | 基因檢測結果顯示該用户得食管癌幾率較大
飛入尋常百姓家
拉索創立之初,便拿到了3600萬元的天使投資——這是全世界消費級基因檢測行業史上最大的一筆天使投資。
第一個難題擺在李智面前:一個用户的基因數據,哪怕壓縮後也接近幾百MB,這些數據要存儲、計算,還將隨着基因學科的發展越來越多,需要一個極其聰明的“腦子”。
而“成本”又是創業公司的生死線,如何建立可靠、穩定又划算的技術支持體系?
上雲是成本最小的方案。“考慮到穩定性、口碑和技術支持能力,我們創立之初就選擇了阿里雲”,拉索CTO何承雄説。
他是技術行業的老兵了,曾就職于飛信、360,一路看着雲計算、SaaS、移動互聯網從萌芽到澎湃之勢。
他深知,和其他行業不同,基因檢測和生命科學的結合非常緊密,其結構層次有自己的特性;算法也更有專業性;用户的數據安全更是要嚴防死守的紅線。
隨着雲計算技術的進步,目前公有云平台已經可以為基因檢測公司提供大規模、易擴展的數據計算分析能力。
拉索把基因檢測實驗室的基因數據計算交給了雲服務器(ECS),這種彈性可伸縮的計算服務,幫助拉索降低 IT 成本,提升運維效率,使拉索更專注於核心業務創新;面向消費者的核心產品——基因寶App的服務器、數據庫存儲也被部署在雲上,採用了雲數據庫RDS。
地基已夯實,服務器、數據庫嚴陣以待,期待着第一位“來客”。
拉索產品科學副總裁唐祖龍清楚記得,2018年10月21日凌晨4點多,基因寶App第一個版本上線。很快,第一位用户的唾液盒寄來了!
在拉索的廣州實驗室,首位用户的口腔黏膜細胞被從唾液裏提取出來,雙螺旋上攜帶的基因數據,在雲上被輕巧且飛快地檢測、計算、分析,被轉譯成普通現代人可以看懂的祖源分析、遺傳特質、遺傳病變異篩查、用藥風險提示等信息。
圖 | 拉索工作人員用液相質譜儀測試oligo
羅帥介紹,正如“世上沒有兩片完全相同的樹葉”,同一種藥物在不同個體的藥動學、藥效學特性也不同。
一片阿司匹林,有的人用完哮喘的副作用會比普通人大,基因檢測結果可以幫助患者酌情調整用量或選擇備用藥。
圖 | 基因檢測結果提供用藥指導
羅帥記得,最“離奇”的一次,有位用户反饋自己父親是A型血,母親是O型血,但自己的基因檢測結果是AB型。身邊的人紛紛勸他“做個親子鑑定”。
這位用户摸不着頭腦,後來通過羅帥瞭解到,自己其實是非常罕見的孟買血型,這種血型在中國僅有約30例報道。
這意味着,一般血庫都沒有這種血液儲備,如果這位用户有輸血需求,就要預先採血準備。
截至目前,拉索累計為幾十萬用户提供了用藥指導信息、遺傳病篩查、祖源分析等服務。
除了改變人的生活,基因檢測技術也為寵物提供服務。
許多寵物雖然看似健康,卻有可能攜帶致病基因,寵物遺傳病檢測可以從寵物的口腔內壁上的分泌物中,提取寵物細胞和DNA,分析寵物的基因信息,提供個性化的養育、育種建議和醫療健康指引。
何承雄算過一筆賬,同等規模下,用雲節省了50%的人力成本和30%的服務器成本。
對創業公司來説,每一筆省下的成本,都可支撐更多的服務拓展——比如,一個自建的臨牀診斷級別的實驗室,一場快速試錯,或者給羅帥這樣的生命科學從業者更好的待遇。
一個人的“戰場”
創業公司保持着飛快的發展速度,基因寶App一個月迭代2次,願意為基因檢測買單的用户越來越多,拉索需要租用的服務器也越來越多。
圖 | 拉索工作人員在通風櫥進行熒光雜交實驗
業務的轉折性突破發生在2020年。
拉索生物與高校科研機構合作,研發了高密度基因芯片(microarray),涵蓋測序儀、芯片、試劑和軟件一體化解決方案,打破了Illumina、Affymetrix兩家外國公司在這一領域長達20年的壟斷,這是中國公司首次在這一領域實現國產替代,預計2021年上半年實現量產。
基因檢測芯片的成功研製,將基因檢測成本降至原來的一半以下,可預見的是,這將進一步降低基因檢測價格,帶來用户量級增長,拉索預計2021年用户量會從幾十萬增至100萬。
為了承接用户大潮,何承雄提前做了技術架構的調整。拉索原搭建的系統架構已經跟不上業務需求,於是購買了一批新的服務器,逐步將原有架構改成彈性更好的Kubernetes集羣。
“長遠來看,用户量突然爆發時,我們也可以動態租用雲計算的更多資源,只需要非常少的人工干預”,何承雄説。
拉索有20多個開發技術人員,但所有技術後台的運維,都落在了90後姑娘陸霖的肩上。
陸霖的工作的上一家公司採用物理機存儲數據,她最怕聽到的四個字就是——“硬盤壞了”。
“用物理機存儲數據,服務器要多準備幾台,保證高可用,成本高不説,一旦壞了,裏面的數據可能會丟”,出個大點的故障,就得幾個運維人員圍在一起,動不動修上一天。
在拉索,陸霖運維的技術平台均已上雲,“穩定性有保障,少了很多運維成本”,但也意味着,“有很多技術需要學習”。
好在,她身後有一支“虛擬團隊”。工單是她最重要的“幫手”之一。在拉索一年多,她一共提過90多次工單,還加入了雲廠商的飛天會員。
“雲上的產品更新非常快,我有時會遇到各種運維問題,就提工單。”“幫手”和她距離幾千公里,但基本提上去幾分鐘就會有回覆,“有時候技術問題比較棘手,技術支持人員會先回復我,再具體解決”。
有次凌晨,突然有個技術問題,拉索的後台機器自動報警,那時陸霖已經下班休息了。
問題持續了30秒後解除,等陸霖第二天上班看到報警記錄的時候,發現阿里雲的工單支持人員凌晨還發消息解釋了問題原因。
**“就像是一個虛擬團隊,它能支撐我,也能自己解決問題。”**陸霖説。
拉索使用的雲計算產品和架構越來越多,技術支持需求也越來越頻繁。溝通得多了,遠在大連的電銷小二林向一和杭州的服務小二許羣,連北京的陸霖什麼時候上班、什麼時候休假都記在心裏,還組織產品經理、架構師上門拜訪,為拉索推薦了基因計算的優化解決方案。
圖 | 工作人員使用移液槍定量實驗
高密度基因芯片研發成功之後,技術突破的故事還將繼續。
羅帥當年埋下的種子已經發芽,藉助人類基因圖譜這張密卷,他正為越來越多人提供疾病風險的前置提醒,趕走他們門前的“妖怪”。
羅帥年近三十,最怕父母身體出問題。父親是個“不聽勸的倔老頭”,吸煙、喝酒如家常便飯,後來被羅帥拉着做了基因檢測,一看檢測結果顯示得糖尿病的風險較高,“不倔了”,煙、酒老老實實戒了,每次羅帥回家,都要拉着他去打乒乓球。
看着父親的身影,羅帥忍不住感嘆:“我們仰望星空,不就是為了讓身邊的人過得更好嗎?”
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