新冠溯源信息彙總1——流行病學調查_風聞
大牧_43077-2021-06-16 16:12
新冠溯源信息彙總1——流行病學調查
yujiunang 來源知乎本文記錄自疫情爆發以來,全球各國在流行病學調查方面取得的溯源成果。按溯源方法,可大致分為五類,以可靠性從高到低排列為:1核酸檢測、2血清抗體檢測、3污水微量病毒檢測、4胸部CT掃描、5身體類似症狀等,其中2和3的可靠性差不多,即1>2≈3>4>5。
下面以一張圖概括迄今為止各國的溯源情況,圖中列出了各國發現的最早病例情況或病毒存在跡象,其中縱座標是時間,只收錄到2019年底,橫座標是證據可靠性,圖中標識“弱”字的代表這條信息可靠性較差(部分是因為現有研究不支持新冠早於2019年9月下旬開始傳播的觀點,參見新冠溯源信息彙總4——系統進化樹)
下面按國家詳細列出各國溯源信息
1、中國2020年1月11日,武漢衞健委公佈武漢最早的新冠發病日期為2019年12月8日,同年2月26日官方再次確認了這一信息。迄今為止這仍舊是中國官方承認的最早病例。
2020年1月24日,期刊《柳葉刀》發表中國學者研究[1],文中顯示武漢首例新冠患者出現在2019年12月1日。同年2月18日、19日相關媒體的採訪披露了患者部分信息。
2020年4月8日,期刊《自然·微生物學》發表武漢疾控中心研究[2],在對2019年10月6日至2020年1月21日收集的640份咽拭子樣本進行檢測後發現,最早的陽性樣本出現在1月4日。
武漢疾控中心《自然》子刊發文:在一月初武漢呈流感狀患者體內檢測出新冠病毒
此後直到世衞調查組來華,再沒有中國境內的有價值溯源信息被公開報道。
2021年3月30日,世衞調查報告正式發佈[3],其中披露對2019年10月至12月的9522份呼吸道樣本(其中武漢658份,湖北非武漢6460份,陝西2404份)進行的檢測結果均為陰性,同時篩查得到2019年10月1日至12月10日間符合新冠臨牀症狀的92人也均被排除新冠感染。報告由此得出結論,認為武漢在2019年10月、11月未發生大規模病毒傳播。
[1] Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China[2] SARS-CoV-2 detection in patients with influenza-like illness[3] WHO-convened global study of origins of SARS-CoV-2: China Part
2、美國2020年1月20日,美國首例新冠病例在華盛頓州確診,患者2019年11月開始在武漢旅行,1月15日回國,次日發病。迄今為止,這仍舊是美國最早的核酸檢測確診病例。
2020年4月3日,一位美國醫生髮現自己血液抗體檢測呈陽性,由於其在2020年1月第一週曾患嚴重流感樣疾病,因此懷疑自己當時已感染新冠。但也有人提出質疑,且該醫生前兩次檢測為陽性,後兩次檢測為陰性,提示檢測試劑盒可靠性存疑。
2020年4月6日,俄勒岡州公佈了一份社區血清抗體調查報告,在採集自4月2日至4日的40份樣本中有1份強陽性、3份弱陽性,其中呈強陽性者報告其在2019年12月曾患嚴重流感樣疾病。該報告傳入國內後被誤傳為40%樣本陽性(實際10%)。
2020年4月7日,麻省理工學院在預印本公佈了對馬薩諸塞州污水的檢測結果[1],在3月18日至25日收集的污水樣本中檢測出了高水平新冠病毒,但1月8日與1月11日的樣本檢測結果均為陰性。
多個國家計劃對污水中SARS-CoV-2開展大規模篩查研究,監測病毒傳播和疫情發展
2020年4月12日,西雅圖流感研究所公佈了對1月1日至3月10日的數千份樣本核酸檢測結果(1月3600份,2月3308份),其中最早的陽性樣本出現在2月21日。
2020年4月21日,北加州聖克拉拉縣公佈的屍檢報告顯示,美國首例新冠死亡病例可追溯至2020年2月6日,比早前所知提前了23天。
2020年4月30日,新澤西州貝爾維爾市長表示懷疑自己去年11月已感染新冠,理由是自己在2019年11月16日曾感不適,11月21日起病情逐漸加重至高燒,而在最近血液抗體檢測呈陽性。
CGTN專訪新澤西貝爾維爾市市長:“我在去年11月已感染新冠肺炎”
2020年5月16日,華盛頓州有兩人被懷疑去年12月已感染新冠,其中一名護士在2019年12月27日發病,並在最近的血清抗體檢測呈陽性。
重磅!美國華盛頓州去年12月底發病的兩名患者新冠病毒抗體檢測結果呈陽性!
2020年6月30日,美、日兩國聯合團隊在期刊《全面環境科學》發文[2],在對路易斯安那州2020年1月至4月的污水樣本進行檢測後,發現4月8日和4月29日的樣本中含有病毒,但1月13日、2月3日和3月2日的樣本均未檢測出病毒痕跡。
北美也沒躲過!美國廢水中發現新冠病毒:“危險一直被低估”_產經 - 手機前瞻網
2020年8月27日,加州大學團隊在《自然·生物技術》期刊發表研究[3],在使用各種商用試劑盒對108份2018年7月前的血液樣本進行檢測後發現,相當一部分樣本檢測結果依舊呈陽性,其中一種試劑盒的陽性率甚至超過15%(17份陽性)。這提示血清抗體檢測結果存在假陽性可能。
馬斯克新冠檢測陽性,四次檢測,兩陰兩陽,血清學檢測真不是開玩笑?
2020年11月30日,期刊《臨牀傳染病》公佈了美國疾控中心的研究成果[4],在對2019年12月13日至2020年1月17日的7389個血液樣本檢測後發現,共有106份陽性樣本,其中一例採集自2019年12月13日至16日的樣本經進一步特異性檢測,可明確是新冠病毒感染。
2021年6月15日,美國學者在《臨牀傳染病》雜誌發表新研究[5],在集中檢測了2020年1月2日至3月18日的2.4萬餘個血液樣本,並與2019年初的血樣對比後,發現總共9例陽性樣本中有2例早於美國已知最早確診的華盛頓州病例,其中最早的陽性樣本為1月7日。
[1] SARS-CoV-2 titers in wastewater are higher than expected from clinically confirmed cases[2] First detection of SARS-CoV-2 RNA in wastewater in North America: A study in Louisiana, USA[3] Evaluation of SARS-CoV-2 serology assays reveals a range of test performance[4] Serologic testing of U.S. blood donations to identify SARS-CoV-2-reactive antibodies: December 2019-January 2020[5] Antibodies to SARS-CoV-2 in all of US research program participants, January 2 - March 18, 2020
3、意大利2020年1月31日,兩名來自武漢的中國遊客在羅馬確診,為意大利當時報告的最早病例。早期的意大利只有零星三個病例,直到2月21日倫巴第大區確診了第四例,隨即該地區疫情大爆發。國內曾有傳聞把該病例稱為意大利“零號病人”,並稱其是在夏威夷感染,但該説法為謠言,倫巴第病例的感染途徑至今不明。
2020年3月11日,米蘭科研團隊發表研究,根據病毒基因測序結果,認為意大利“零號病人”是2020年1月25日至26日由德國入境,該結論在德意兩國間引發爭議。
2020年3月19日,意大利醫學專家朱塞佩 · 雷穆齊接受採訪時稱一些醫院2019年11月下旬至12月的病例疑似感染新冠,但缺乏證明。
2020年3月20日,意大利學者在預印本發表研究[1],發現倫巴第地區早期病例可追溯至2020年1月1日(正文中提到的最早病例其實為1月14日,1月1日病例來自圖表)。
2020年6月19日,據意大利國家衞生研究院,在對2019年10月至2020年2月的40個污水樣本進行檢測後,發現最早在2019年12月18日採集自米蘭和都靈的樣本中就檢測出了病毒痕跡。
2020年11月11日,意大利國家腫瘤研究所在期刊《腫瘤雜誌》發文[2],在採集自2019年9月至2020年3月的959份血液樣本中,每月都能檢測出大量抗體陽性,其中最早的樣本為2019年9月3日。由於陽性率過高(9、10兩月分別為14.2%、16.3%),該研究結果引發質疑,目前世衞正在對該研究進行復查。
2020年12月9日,米蘭大學團隊在期刊《新發傳染病》發文[3],稱一份採集自2019年12月5日的兒童咽拭子樣本核酸檢測呈陽性,由於該兒童於2019年11月21日發病,因此該病例可明確早於武漢已知首例確診。
2021年1月11日,米蘭大學團隊在期刊《英國皮膚病學雜誌》發文[4],稱在一份採集自2019年11月10日的年輕女子皮膚樣本中檢測出了新冠病毒,該發現再次刷新了新冠早期病例上限,成為全球目前已知的最早確診病例。
[1] The early phase of the COVID-19 outbreak in Lombardy, Italy[2] Unexpected detection of SARS-CoV-2 antibodies in the prepandemic period in Italy[3] Evidence of SARS-CoV-2 RNA in an Oropharyngeal Swab Specimen, Milan, Italy, Early December 2019[4] COVID-19-related dermatosis in November 2019: could this case be Italy’s patient zero?
4、法國2020年4月28日,據法國巴斯德研究所研究成果[1],法國境內的新冠毒株與中國毒株分屬不同分支。法國最早的病例確診於2020年1月24日(同時也是當時歐洲最早病例),其中一人為曾途徑武漢回國的華裔,另兩人為來自武漢的夫妻,該研究提示法國本土病例可能有更早來源。
2020年5月3日,法國學者在期刊《國際抗菌劑雜誌》發表研究[2],發現一例2019年12月27日入院的男子新冠檢測呈陽性,該男子於2019年12月24日發病,該研究成果將法國最早病例提前了一個月。
2020年5月7日,法國一家醫院通過對去年11月起拍攝的胸部影像進行分析,發現最早拍攝於2019年11月16日的一張影像疑似已感染新冠。在進一步檢測後,確認一名2019年12月2日入院的男子感染新冠。
2021年2月6日,法國學者在期刊《歐洲流行病學雜誌》發文[3],在對2019年11月4日至2020年3月16日採集的9144份血液樣本分析後確認,至1月30日的樣本中共有13份血清抗體二次檢測呈陽性,其中最早的樣本為2019年11月5日。
[1] Introductions and early spread of SARS-CoV-2 in France[2] SARS-CoV-2 was already spreading in France in late December 2019[3] Evidence of early circulation of SARS-CoV-2 in France: findings from the population-based “CONSTANCES” cohort
5、英國2020年9月9日,英國媒體報道一位2020年1月30日去世的老人被確認感染新冠,該患者於2019年12月28日發病。此前英國首兩例新冠確診於2020年1月31日,為一對中國留學生母子。
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6、西班牙2020年6月13日,西班牙學者的一項研究發表在預印本平台[1],研究人員對2018年至2020年的巴塞羅那污水樣本進行分析後,發現2019年3月12日的一份樣本呈陽性。不過由於時間太早,陽性反應偏弱,且之後直到2020年1月15日的樣本才重新出現陽性反應(2019年9月10日至12月11日的四份樣本均呈陰性),因此該結果倍受質疑。
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2020年11月21日,西班牙媒體報道據本國衞生部最新資料,西班牙最早的新冠病例可追溯至至少2020年1月1日,但沒有公佈具體細節。此前西班牙首個新冠病例為一位確診於2020年1月31日的入境德國人。
[1] Sentinel surveillance of SARS-CoV-2 in wastewater anticipates the occurrence of COVID-19 cases
7、巴西2020年4月2日,巴西衞生部公佈消息,稱該國早在1月23日即有人死於新冠(此前巴西首例新冠確診於2020年2月25日,為一位自意大利回國的企業家)。但次日官方就更正信息,稱該病例實際死於3月23日,之前的説法為輸入錯誤。
2020年6月26日,巴西研究人員在預印本平台發表研究成果[1],稱在對2019年10月30日至次年3月初收集的污水樣本進行分析後,發現最早2019年11月27日的兩份污水樣本即存在微量病毒痕跡。
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2021年1月12日,巴西研究人員在分析了2019年12月1日至次年6月30日的7370份血樣後,發現210份樣本血清抗體呈陽性,其中最早一例為2019年12月18日。
[1] SARS-CoV-2 in human sewage in Santa Catalina, Brazil, November 2019
8、日本2020年5月5日,一名叫福島淳也的醫師在臉書發文,稱他的團隊發現一份採集自2019年9月24日的血液樣本抗體檢測呈陽性,該樣本來自一名2019年8月20日出現症狀的女性。該項研究未見公開發表,因此可靠性存疑。此前日本於2020年1月15日確診首個新冠病例,為一位1月3日發病,1月6日入境的武漢男子。
2020年5月15日,日本厚生勞動省發佈了對部分血清抗體檢測試劑盒的測試結果,在採集自2019年1月至3月的500份樣本中,有2份樣本呈陽性。考慮到測試的目的是檢驗不同廠家試劑盒的準確性,該結果假陽性的可能性較大。
