陳根:Delta變異毒株世界盛行,新冠病毒何以突變?_風聞
陈根-知名科技作家为你解读科技与生活的方方面面。2021-06-21 09:07
文/陳根
隨着新冠疫苗的穩步接種,全球新增新冠病例數量顯著放緩,各國經濟也正逐漸恢復和開放。然而,儘管人類寄希望於公共衞生防控手段以及疫苗手段來阻斷它的傳播,但理想與現實總是相隔着一段不小的距離——作為一種RNA病毒,新冠病毒最大的特點之一就是容易變異。
**從變異株阿爾法(Alpha B.1.1.7 )到貝塔(Beta B.1.351),再到伽瑪(Gamma P.1)和德爾塔(Delta B.1.617.2),**每次變異,新冠病毒都攜帶着更強的傳播力。當前,印度發現的Delta變異株因為傳播能力顯著增強,正在成為全球主要流行的新冠病毒變異株。
新的變異毒株正在攻破各個國家的防線,攻破包括我國在內的東亞、東南亞等其他國家的防線**,而其更是在攻破公共衞生防控防線後,開始挑戰疫苗防線**。面對來勢兇猛的新冠病毒變異毒株,與新冠病毒的共存成為新常態,疫情依然是不確定的,建立新防線與病毒共存終於還是成為了必然。
新冠突變何以變?
想要理解新冠病毒的頻繁突變,還需要從病毒的結構開始講起。
病毒作為由一個核酸分子和蛋白質構成的非細胞形態,靠寄生生活的有機物種。病毒分為DNA病毒和RNA病毒兩大類**。**其中,DNA病毒可以分為雙鏈DNA病毒、單鏈DNA病毒、雙鏈DNA逆轉錄病毒三種;RNA病毒又可以分為雙鏈RNA病毒、(+)單鏈RNA病毒、(-)單鏈RNA病毒和單鏈RNA逆轉錄病毒四種。
在病毒從基因組到蛋白質的轉變中,需要生成mRNA以完成蛋白質的合成和基因組的複製,不同的的病毒家族完成此過程的機制存在差異。而與DNA病毒疫苗相比,RNA病毒的病毒穩定性更差,變異速度更快,突變率也****更高。
新冠病毒就是一類(+)單鏈RNA病毒。新冠病毒所包含的單鏈RNA相當於細胞中的mRNA,可以直接在細胞內翻譯出所編碼的蛋白質,如衣殼蛋白和病毒的RNA聚合酶。隨後,在病毒RNA聚合酶的作用下複製病毒RNA,最後病毒RNA和衣殼蛋白自我裝配形成成熟的病毒顆粒。
新冠病毒作為一種有包膜的(+)單鏈RNA病毒,與SARS-CoV和MERS-CoV同為β-冠狀病毒屬,是感染人的第7種冠狀病毒,主要結構蛋白包括S蛋白(棘突)、E蛋白(包膜)、M懂蛋白(跨膜)和N蛋白(核衣殼)。
**在新冠病毒的四種結構蛋白中,刺突蛋白(S蛋白)上的突變位點最多,也最關鍵。**這是因為,刺突蛋白是新冠病毒與人體結合而發生感染的關鍵蛋白,新冠病毒主要就是通過S蛋白與宿主細胞表面ACE2受體結合感染宿主細胞,這也讓刺突蛋白成為絕大多數新冠疫苗發揮保護效力的靶標蛋白。
今年2月,權威期刊《細胞·宿主與微生物》(Cell Host & Microbe)上曾刊登一篇論文,全球第1次系統盤點了****病毒變異的內容。以截至2021年1月11日GISAID數據庫的355067個新冠病毒基因組序列為研究對象,研究人員在這35萬多條基因組序列中發現:
接近30000個突變;3823個新冠病毒突變株具有代表性,也就是基因突變影響了病毒的特性;130個能持續遺傳的核酸突變位點(這些突變能在人羣中傳播和擴散);75個突變為非同義突變(會導致病毒蛋白質發生改變,影響傳播能力或致病能力);24個平行突變位點(不同地區的新冠病毒同時產生了同樣的突變位點)。這樣的突變則有可能提高病毒的適應性和生存能力。
**另外,美國邁阿密大學發表的研究將****新冠病毒發生變異可分為2個階段:**2019年12月-2020年7月,隨着新冠病毒在全球的傳播範圍越來越大,突變速率也逐漸加快;2020年8月-12月,新冠病毒已經在全球大部分國家或地區中廣泛傳播,突變速率也達到了非常高的水平。
**但是,並不是所有發生突變的新冠病毒都能生存下來。**事實上,大多數突變往往對病毒的生存具有不利影響,攜帶不利突變的病毒株不能適應環境,而逐漸消失殆盡;但少數突變會增強病毒的感染性或傳播能力,慢慢演化成優勢的變異毒株。
**而引起全球範圍內疫情反覆上行的新冠病毒突變株,正是從這麼多新冠病毒突變株中脱穎而出的變異病毒。**從變異株阿爾法(Alpha B.1.1.7 )到貝塔(Beta B.1.351),再到伽瑪(Gamma P.1)和德爾塔(Delta B.1.617.2),每次變異,新冠病毒都攜帶着更強的傳播力。
病毒突變拉長戰線
事實上,最早於2020年9月發現於英國的新冠變種病毒“阿爾法”也並不叫“阿爾法”。其之所以被命名為“阿爾法”,**則源於世衞組織5月31日宣佈的****新冠病毒主要變異毒株的新命名方式,即用希臘字母如Alpha(**α),Beta(β),Gamma(γ)等標記。
因此,按照新規則,最早於2020年9月發現於英國的新冠變種病毒(編號B.1.1.7)被命名為Alpha(α);2020年5月發現於南非的新冠變種病毒(編號B.1.351 )被命名為Beta(β);2020年4月-11月發現於巴西的新冠變種病毒(編號分別為P.1、P.2)分別被命名為Gamma(γ)、Zeta(ζ)。
值得一提的是,不論是英國變異毒株Alpha,還是南非變異毒株Beta,又或者是巴西的變異毒株Gamma(γ)、Zeta(ζ),雖然是在三個國家獨立出現,但它們攜帶着幾個共同的基因變異,比如都有N501Y突變,只是三者的突變位點各不相同****而已。
其中,英國變異毒株Alpha的N501Y突變意味着,刺突蛋白的第501個氨基酸殘基發生變化;編碼的氨基酸從天冬醯胺(縮寫N)變成了酪氨酸(縮寫Y);刺突蛋白的第501位氨基酸能直接影響病毒與人體細胞的結合。而其導致的最直接結果就是,病毒傳染性顯著變強——感染者的增長率比其他變異毒株高71%。
2020年7月30日,中國科學家周育森等人發表在 Science 的研究再一次表明,新冠病毒適應和感染野生型小鼠,正是因為有了這個 N501Y突變。該突變大大增加了RBD與受體ACE2的親和力,能使本來不感染小鼠的新冠病毒毒株變得能夠感染小鼠。
而2020年9月發表在 Cell 的一篇論文也顯示,美國福瑞德·哈金森癌症研究中心和華盛頓大學的科學家發現,新冠病毒受體結合區域相當多的氨基酸突變增強了與ACE2結合的能力,其中就預測了位點N501F/T的突變增強與人ACE2親和力,但他們當時並沒有證據表明正在流行的毒株產生了這些突變。
可以説,N501Y突變大名鼎鼎,直接導致了倫敦的封城。所幸的是,儘管N501Y突變讓病毒的傳染性更強了,但N501Y突變並未****影響疫苗效力。英國首席科學顧問帕特里克·瓦倫斯在今年1月22日表示,疫苗對新病毒的預防效力,和對舊病毒的一樣有效。
英國變異毒株Alpha已讓人感受到突變毒株傳染力之強的壓力,南非變異毒株Beta以及巴西的變異毒株Gamma(γ)、Zeta(ζ)更是在病毒除了N501Y突變外,新增了E484K突變,也就是刺突蛋白第484位氨基酸發生變化,從穀氨酸(E)變成了賴氨酸(K)。
其中,南非或者“Beta”變種(B.1.351)已經在另外至少20個國家被發現,包括英國。巴西或者“Gamma”變種(P.1)也已經傳播至另外超過10個國家,包括英國。
2021年1月4日,美國福瑞德·哈金森癌症研究中心發佈的論文指出,**存在E484K突變的病毒會使康復者的中和抗體(能幹掉進入體內的病毒)效力下降,**最高可下降10倍以上。當前,這隻能説明,康復者對具有E484K突變的病毒防禦力降低,並不能説明疫苗的效力變化。但這也足夠令人警惕。
可以説,作為一種RNA病毒,新冠病毒容易變異的特點也一再地拉長了人們對抗新冠疫情的戰線。
Delta變異毒株****世界盛行
2020年10月發現於印度的兩種新冠變種病毒(編號B.1.617.2、B.1.617.1)則分別被命名為Delta(****δ)、Kappa(κ)。而發現於印度的Delta正是當前全球主要流行的新冠病毒變異株。據英國媒體報道, Delta變異毒株已在74個國家和地區被發現,並繼續迅速傳播。
《柳葉刀》雜誌14日發表的一項大規模研究結果顯示,來自英國愛丁堡大學領導的研究團隊發現,與感染Alpha變異毒株的患者相比,感染Delta變異毒株的患者住院風險要高出一倍。Delta似乎更容易傳播,也更容易導致更嚴重的疾病。
在6月11日舉辦的國務院聯防聯控機制新聞發佈會上,中國疾控中心研究員馮子健指出,此次廣州疫情是由在印度肆虐的Delta變異株引起。5月21日至6月18日,廣州累計新增報告境內確診病例173例。
另據深圳市衞健委6月19日消息,6月18日,深圳市新報告2例新冠肺炎確診病例,其中一例病例朱某是深圳寶安國際機場某餐廳服務員。6月18日,深圳市疾控中心完成朱某的新冠病毒基因測序,其攜帶的病毒與CA868國際航班輸入的3例陽性病例和6月14日報告的確診病例姜某完全同源,均為Delta變異株。
而在英國,當地時間6月18日,英國英格蘭公共衞生署發佈報告表示,自6月11日以來,感染Delta毒株的病例增加了33630例,根據最新測序和基因分型數據顯示,過去一週,英國目前有99%的確診病例感染了Delta毒株。另據英格蘭公共衞生署信息,截至6月14日的一週中,英國共有806人因感染Delta毒株發展為重症住院患者,較此前一週增加了423人。
再比如,印尼新冠肺炎工作組新聞發言人維古6月15號確認,Delta已在印尼首都雅加達、東爪哇省古都斯、西爪哇萬隆等多地暴發,目前印尼政府尚無有效的方式來應對其迅速蔓延的情況。近日,印尼的新冠肺炎確診病例數依然呈現迅速上升態勢,每天的新增確診病例數都達到了8000到10000人左右。
Delta變異毒株威力不容小覷。從阿爾法(Alpha B.1.1.7 )到德爾塔(Delta B.1.617.2),新冠的變異毒株正在顛覆人類的防控。不難發現,這四株對人類影響較大的新冠病毒變異毒株,每一株變異的時間均發生在疫情爆發期,疫情越嚴重,病毒變異的機會越增加。建立抗疫建立新防線刻不容緩。
無疑,進入疫苗階段後,病毒在變化,變異不斷出現,防控策略也應該隨着變化。從全球疫情發展看,在攻破防線的國家中,大多為接種疫苗不足的國家。儘管也存在接種後感染的病例,這是因為,疫苗並不是100%保護。因此,在變異毒株盛行下,疫苗的推廣和普及依然是抗疫的第一要義。
與此同時,面對已經變異的毒株,選擇高效疫苗的接種策略以最大限度地增加找到成功解決方案的機會是必選項。6月2日,在博鰲亞洲論壇全球健康論壇第二屆大會上,國家傳染病醫學中心主任張文宏表示,目前所謂的病毒變異並沒有對疫苗產生逃避,疫苗非常好用。
不管是mRNA的或者腺病毒的疫苗,根據世衞組織剛得出的結論,對所有的重要突變包括印度的突變株,全部可以保護。但對我國來説,從有效性上而言,要想實現真正自由流動的羣體免疫,似乎讓人有些無奈。科興疫苗作為國內保護效力最高的疫苗,根據其提交給世衞的數據,巴西試驗有效率50.7%,智利67%。
平均一下,其有效率只有59%,而基於mRNA技術的復必泰有效率則高達95%。也就是説,即便是我國接種了百分之百的人羣,其能實現的有效免疫也只有59%,而歐美接種一個就算一個,幾乎不用打折。
當前,疫情的局部流行依然是常態,未來的疫情發展趨勢也將在很大程度上取決於人們接種疫苗、獲得免疫以及病毒的演變情況。與新冠病毒的共存成為新常態,疫情依然是不確定的,人們終究還是走向了與病毒共存的世界。