如何看待新冠病毒疫苗(上)_風聞
梦想去飞翔-临床医学硕士-做一个靠谱医生。2021-07-18 19:36
一,冠狀病毒的特徵
已知冠狀病毒為RNA病毒,它的RNA基因組編碼4種或5種結構蛋白,分別為
棘突(spike, S)蛋白、
膜(membrane, M)蛋白、
核衣殼(nucleocapsid, N)蛋白、
血凝素酯酶(hemagglutinin-esterase, HE)蛋白(只有HCoV-OC43和HCoV-HKU1有表達)
包膜(envelope, E)蛋白
最早發現的冠狀病毒是HCoV-229E、HCoV-OC43;2003年發現了SARS-CoV;此後又很快發現了HCoV-NL63、HCoV-HKU1;2012年發現了MERS-CoV。
這次爆發流行的是 SARS-CoV-2 (也曾命名為2019-nCoV);
在抗擊2003年SARS-CoV、MERS-CoV時,醫學界就開始了針對性的疫苗開發[1~3]。當時的研究就支持選擇冠狀病毒的棘突蛋白(Spike或簡稱S蛋白)作為靶抗原。
我們人為製造出冠狀病毒的S蛋白,並採用各種技術思路送入人體送入人體當中,用它訓練和激活人體的免疫系統,從而對抗未來可能入侵的新冠病毒。
為什麼選擇S蛋白?
因為S蛋白與宿主細胞上的血管緊張素轉換酶2(ACE2)受體結合並誘導膜融合[4]。
與SARS-CoV-1、MERS-CoV疫苗研究的數據類似,我們同樣觀察到針對SARS-CoV-2棘突蛋白的受體結合域(RBD)的抗體可以阻止病毒附着到宿主細胞,且能中和病毒的觀察結果。很自然,棘突蛋白、以及RBD成為COVID-19疫苗開發的主要抗原靶點[5]。
冠狀病毒的示意圖
二,新冠疫苗的技術路線
目前主要的已上市的新冠疫苗的主要技術路線如下:
1,滅活疫苗:
科興生物(Sinovac)
國藥集團(Sinopharm)中國生物、
武漢生物製品研究所
2,重組蛋白疫苗
美國諾瓦瓦克斯公司(Novavax);它主要採用NVX-CoV2373。、
俄羅斯的國家病毒學和生物技術研究所(Vector)
中國三葉草疫苗(SCB-2019)
3,腺病毒載體疫苗
中國康希諾公司(CanSino)、
美國強生公司(Johnson & Johnson)、
英國阿斯利康公司(AstraZeneca)、
俄羅斯加馬利亞研究所(Gamaleya)
阿斯利康公司跟牛津大學合作,選擇的是ChAdOx1 nCoV-19/AZD1222(複製不全的黑猩猩腺病毒載體)。
強生公司採用腺病毒26作為載體。
中國康希諾公司採用腺病毒5作為載體。
俄羅斯加馬利亞研究所的疫苗Gam-COVID Vac/Sputnik V。它是以腺病毒26載體初始劑量肌肉注射,21天后以腺病毒5載體增強劑量肌肉注射。
4,核酸疫苗,或者叫RNA疫苗
美國莫得納(Moderna)公司、
德國BioNTech公司
德國的BioNTech公司的開發過程中,美國輝瑞(Pfizer)和中國的復星公司也有深度參與,所以也經常被人們叫做輝瑞疫苗。
輝瑞公司採用的是BNT162b2。
Moderna公司採用的是mRNA-1273。該疫苗還使用該公司的專利Matrix-M佐劑。
(這部分主要參考了王立銘、莊時利和兩位老師的文章。)
三,不同的疫苗技術路線
1,滅活疫苗
滅活疫苗是一個經典的疫苗開發方法。其方法就是在實驗室和工廠裏大規模培養病毒,然後使用物理方法或化學物質破壞病毒的活性,再添加一些能夠增強免疫反應的化學物質(學名叫做佐劑),最終制成成品疫苗。
注射滅活疫苗後,在理論上我們不能確定產生抗體針對的靶抗原是什麼。不過實際臨牀工作裏,發現注射滅活疫苗後,人體產生的抗體的靶抗原跟其他疫苗差別不大。
2,非滅活疫苗的技術路線
①,重組蛋白疫苗
就是人為把S蛋白的構象做改造,然後在工廠裏生產出改造過的S蛋白,然後聯合佐劑注射體內,從而誘導人體發生抗體。
Novavax疫苗的S蛋白有兩個改造的地方,一個是使用了S-2P技術,插入了兩個脯氨酸(K986P和V987P),另外一個在Furin酶切位點有三個突變(R682Q、R683Q和R685Q)。
這個小小的改變可以很好地穩定S蛋白構象,使得絕大部分的S蛋白都處於Prefusion的三聚體構象狀態。
S-2P技術也運用在多種新冠疫苗上,包括兩種mRNA疫苗(輝瑞、Moderna)以及腺病毒載體疫苗(強生)上。
②,腺病毒載體
把腺病毒加以改造,把負責生產新冠病毒S蛋白的基因放進去,然後直接把活的腺病毒注射到人體。
這些病毒進入人體之後可以感染一部分人體細胞,指揮這些人體細胞生產S蛋白。這樣乾脆把在工廠裏生產S蛋白的步驟也給省略了,直接把人體變成疫苗生產車間。
③,核酸疫苗,或者叫RNA疫苗
這條技術路線就是製造出大量的、編碼刺突蛋白的RNA分子,用脂納米顆粒包裹起來,直接注射到人體中。
這些脂納米顆粒可以和人體細胞融合,把RNA分子釋放進入人體細胞。從而指揮人體細胞生產S蛋白。也同樣省略了工廠生產S蛋白。
這條技術路線相對而言是最新的,在新冠疫情之前,人類還沒有將任何一款核酸疫苗推進到3期臨牀。
可以通過社交媒體學習到很多知識。本篇很多內容經我查證後而摘自新浪微博。
四,關於疫苗的保護效果
隨機對照研究時,保護率數據是這樣計算的:
沒打疫苗的感染率=A
打疫苗後的感染率=B
保護率數據=(A-B)÷A
很顯然,保護率數據不只是由打疫苗後的感染率(即數據B)決定的。也很大程度受沒打疫苗的感染率(即數據A)的影響。(感謝微博好友xiongyongqiang糾正了我的錯誤觀點,從而才有了本篇正確的疫苗保護率計算方式。)
然而,當疫苗接種率高漲,整個人羣的感染率下降時-----這恰恰證明疫苗有很好的保護效果。你可以發現計算出來的疫苗的保護率數據反而可能是下降的。
我們同樣也可以發現,不同疫苗的保護率數據不好做對比------除非在同一個隨機對照試驗裏。
因為不同緯度地區,不同社區人羣(有不同的社交活動習慣),他們的基礎感染人數(即數據A)是大大不同的。
而且,不同隨機對照試驗裏的數據B的定義也可能有差異;因此,不同隨機對照試驗裏的疫苗保護率不宜做直接對比。
目前各個已上市疫苗的保護率數據都可以查詢到。可以發現國產疫苗的保護率數據不如BNT等國外疫苗。但因為不是同一個隨機對照試驗出來的,所以這些保護率數據是不能做對比的。
實際上,我只看到了英國的一個研究是直接對比BNT跟阿斯利康疫苗。該對照試驗結論是:BNT疫苗好過阿斯利康疫苗。
因此,我後面提到的系列研究要注意幾點:
不在一個隨機對照研究裏做對比,不同疫苗的保護率數據不可做直接對比。
真實世界的保護率數據受多因素影響;比如接種人數上升後,導致感染率下降的影響。
1,烏拉圭的真實世界數據
在今年5月時,南美洲國家烏拉圭衞生部的跨學科團隊撰寫的《疫苗有效性報告》日前公佈。該報告的結果是根據截至5月25日86.27萬人完全接種疫苗後的數據得出的,其中71.27萬是科興疫苗,15萬是輝瑞疫苗。
在完成兩劑科興疫苗接種的71.27萬人中,僅有5360人在接種第2劑疫苗14天后新冠檢測呈陽性,其中19人需要進入重症監護病房治療,6人死亡。
烏拉圭的數據顯示,科興疫苗能降低感染率57%,輝瑞疫苗能降低感染率75%;科興疫苗使重症監護率降低95%,輝瑞使重症監護率降低99%;輝瑞預防新冠病患者死亡的有效率則是80%,比科興的97%低。
該研究是真實世界研究。因為並非同時開展的隨機對照試驗,因此還不能依此斷定兩個疫苗的優與劣。
2,泰國的醫護人員數據
今年7月,泰國宣佈68萬名醫護人員完成接種兩劑中國科興滅活疫苗,4月至今共有618名醫護人員確診感染新冠病毒,其中1名護士病亡,另1名醫護情況危重。
請注意,因為是醫護人員。所以,他們的自我防護意識比較強,所以這個突破感染率是不能推廣到所有人羣的。
6月28日~7月2日,泰國對2239個新冠確診病例樣本進行檢測,感染德爾塔毒株(印度 變異)的佔比約32.2%~52.2%。
那麼沒有接種的數據呢?泰國醫護人員科興接種比例是97%。而沒有接種的感染人數是2萬,而感染人數100多,死亡6人。估算結果是真實世界保護率為80%。
3,來自美國的真實世界數據
美聯社分析了 5 月份的數據,發現 853,000 多例新冠住院病人中,99.9%沒完成疫苗接種;在超過 18,000 例新冠死亡病例中,99.2%沒完成疫苗接種。美國CDC主任説,這些成年人的死亡本可避免的。美國現在新冠已經變成未接種者的流行病。
實際上,美國6~7月的新冠感染人數再次反彈。但主要發生在那些接種率低於40%的地區,而且也主要是那些未接種疫苗的人罹患。
4,來自土耳其的隨機對照研究數據
今年7月,土耳其Hacettepe大學在Lancet發表了重磅文章,報道了科興滅活病毒疫苗ConoraVac在該國3期臨牀試驗結果。在這項3期RCT臨牀試驗中,被隨機分組後,6646人接受疫苗,3470人接受安慰劑。研究按照ITT開展。在接種兩劑後的43天隨訪中,疫苗接種組9人發生有症狀感染,安慰劑組32人感染。由此計算的疫苗保護率為83.5%(95% CI 65.4–92.1;p<0·0001)。
5,來自智利的真實世界數據
今年7月7日,智利衞生部在《新英格蘭醫學雜誌》上公佈了科興新冠疫苗在智利的真實世界保護率數據。
該研究於2021年2月2日至5月1日進行,共統計1020萬人。在接種完2針的人羣中,預防Covid-19的效力為65.9%,預防住院的效力為87.5%,預防ICU的效力為90.3%,預防Covid-19相關死亡的效力為86.3%。
6,哥倫比亞的真實世界數據
哥倫比亞《週刊》7月8日報道:該研究由哥倫比亞衞生當局發起,針對哥倫比亞應用數量最多的新冠疫苗——科興滅活疫苗(Sinovac)和輝瑞mRNA疫苗(Pfizer),統計了各年齡段受種者在完全接種2款新冠疫苗後被突破感染而死亡的幾率。結果如下:
20歲以下及20到49歲的年輕人羣:輝瑞疫苗和科興疫苗均為0;50到59歲:輝瑞疫苗為0.023%,科興疫苗為0;60到69歲:輝瑞疫苗為0.033%,科興疫苗為0.03%;70到79歲:輝瑞疫苗為0.0137%,科興疫苗為0.0329%;80歲及以上:輝瑞疫苗為0.088%,科興疫苗為0.083%。
總的來説,接種疫苗是必要的。無論是國產疫苗,還是其他國際疫苗的有效率都較為理想。
相對可肯定的是,輝瑞/BNT疫苗為代表的mRNA疫苗的保護率似乎要稍好於其他疫苗。比如,英國一項嚴格的隨機對照研究裏,BNT疫苗的保護率要稍好於阿斯利康疫苗。但差距並不大。
但是,保護率點滴差距並沒有那麼重要。只要有足夠多人接種疫苗,都足以讓該病遠離我們。唯一要擔心的是接種人羣不夠多,以及接種的副反應。
(接種副反應等問題留待後續)
特別感謝來自新浪微博的朋友:
1,為格命思奔 。他本人在冠狀病毒疫苗的研發方面做出過傑出貢獻,比如對S蛋白的構象改造,從而讓新冠疫苗成為可能。本文參考了他多篇新浪微博的文章。
2,莊時利和。他寫過很多高質量的新冠疫情的文章。他對疫苗裏的S蛋白改造的解讀讓我學到很多。從他那裏學習到很多知識。
3,王立銘。王老師的文章《巡山報告 No.24:有了疫苗,世界會好麼?》通俗易懂,可以作為理解新冠疫苗的門檻。本篇文章大量引用該篇文章內容。
4,子陵在聽歌。他持續不斷為我們解讀各種新發表的學術研究論文,尤其是感染病學、疫苗等領域的內容。讓我對新冠感染的最新進展不陌生。
5,LeBonHomme。我從他學到了很多關於新冠病毒,以及如何研讀疫苗的保護率數據的研讀等,
6,xiongyongqiang。我曾寫微博涉及疫苗保護率計算方式。但我搞錯了,是他糾正了我。我從他那裏學習到很多知識。
7,鼎盛風清。從他的微博可以找到各種新冠疫苗研究的數據,是一個關於新冠疫苗研究的寶藏。最後一個關於哥倫比亞的研究報告完全摘自他的微博。
實際上,我還從其他不少朋友那裏學習到很多。本篇文章大量參考了他人的文章、微博內容,但卻未能一一致謝。
參考資料:
1,Graham RL, Donaldson EF, Baric RS. A decade after SARS: strategies for controlling emerging coronaviruses. Nat Rev Microbiol 2013; 11:836.
2,Tortorici MA, Veesler D. Structural insights into coronavirus entry. Adv Virus Res 2019; 105:93.
3,Pallesen J, Wang N, Corbett KS, et al. Immunogenicity and structures of a rationally designed prefusion MERS-CoV spike antigen. Proc Natl Acad Sci U S A 2017; 114:E7348.
4,Zhou P, Yang XL, Wang XG, et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature 2020; 579:270.
5,Krammer F. SARS-CoV-2 vaccines in development. Nature 2020; 586:516.