陳根:泛素化的底物,可以不是蛋白質?_風聞
陈根-知名科技作家为你解读科技与生活的方方面面。2021-07-18 08:13
文/陳根
泛素(ubiquitin)是一類存在於真核生物中的小蛋白,由76個氨基酸組成,主要功能是標記需要分解掉的蛋白質。其也可以標記跨膜蛋白,參與蛋白質的膜泡運輸。在細胞信號傳導,內吞,以及DNA損傷修復中,非典型泛素鏈佔據着重要地位。
泛素化是泛素分子在一系列特殊的酶作用下,將細胞內的蛋白質分類,從中選出靶蛋白分子,並對靶蛋白進行特異性修飾的過程。這一過程一般是,泛素先由E1活化酶活化,然後被轉移到E2結合酶,最後由E2結合酶轉交給E3連接酶,再由E3連接酶找到蛋白底物完成泛素化修飾。
可以説,泛素化在蛋白質的定位、代謝、調節和降解中扮演着關鍵角色。同時,它也參與着細胞增殖、凋亡、分化、轉移、損傷修復等眾多生命活動的調控。此外,泛素化與腫瘤、心血管等疾病的發病也密切相關。
作為近年來生物化學研究的一個重大成果,泛素化已然成為開發新藥物的熱門對象,其底物通常也被認為是蛋白質。但近日,英國劍橋大學的研究人員發現,泛素化的底物竟然可以不是蛋白質,脂多糖也可以**。**
研究人員利用泛素化酶(來自人類宿主細胞的提取物)以及不同菌株的細菌,設計了一個體外重建泛素化實驗。**結果表明,人類宿主細胞在抗沙門氏菌感染時的泛素化底物是脂多糖,**並且確定了泛素化修飾的具體位點是脂多糖上的脂質A,作用位點則可能是羥基、磷酸基團。
為了進一步探究,研究人員對HeLa細胞裂解物進行了分離純化以及質譜分析。結果顯示,蛋白質RNF213就是以脂多糖為泛素化底物的E3連接酶。至於RNF213,其是一種新型(591kDa)E3泛素連接酶,它的E3連接酶活性結構域包括RZ結構域、RING結構域和動力蛋白樣的AAA+結構域。
其中RING結構域的缺失對RNF213的E3連接酶活性沒有明顯影響,相比之下,AAA+結構域和RZ結構域對其E3連接酶活性則至關重要。換句話説**,RNF213作為E3連接酶以脂多糖為泛素化底物,參與了細胞抗細菌感染中由泛素化修飾介導的自噬機制。**
值得一提的是,RNF213在將泛素連接到脂多糖分子上之後,還能夠通過另一種E3連接酶進一步放大泛素化信號,以促進沙門氏菌的自噬清除。未來,這個發現有望拓寬泛素化藥物的研發思路。