陳根：新方法統計致癌突變頻率，結果相差較大_風聞

文|陳根

癌症是世界首要死因之一，其特徵在於基因組中的突變或其他改變導致細胞生長不受控制。腫瘤可出現數百至數千種突變，但只有少數幾個基因對其致瘤能力至關重要，比如TP53、PIK3CA、KMT2C、ARID1A、KMT2D、LRP1B、PTEN、RB1、FAT4、KRAS。

這10個基因每個的突變都能導致20多種不同類型的癌症，其中最厲害的就是TP53基因，其突變導致的癌症超過50種。近日，科學家們開發了一種新方法，重新統計分析了泛癌種中致癌突變基因的頻率，結果與此前的認知差距較大。

新方法利用的系統名為ROSETTA（Reclassification Of Sequencing and Epidemiological Tumor Type Annotations），其能夠得到各個癌種在所有癌症中的佔比。最常見的五種癌症是乳腺癌、前列腺癌、結直腸癌、肺腺癌和惡性黑色素瘤，加起來佔50%以上；前十名合計佔比達到68.7%。

在這些癌症中，最常見的致癌突變基因是TP53，35%的新發癌症有它；而被認為最常突變的原癌基因KRAS，只有11%；排名靠前的還有BRAF，佔8%。前十名裏KMT2C、KMT2D、ARID1A是表觀遺傳修飾相關基因，可見癌症中表觀遺傳失調十分常見。

既往的研究普遍顯示，RAS致癌基因在所有人類癌症中出現的頻率大約在30%-33%，但在新的研究中，這個數字實際上只有15%，僅為此前的一半。

此外，大部分突變基因在兩者之間的差距不到5%。腺癌比鱗癌高的僅有KRAS和APC突變頻率差距較大（14%vs1%，13%vs5%）；鱗癌比腺癌高的主要有LRP1B（23%vs10%），KMT2D（16%vs7%），FAT1（15%vs5%），CDKN2A（12%vs2%），NOTCH1（10%vs3%）和NEF2L2（10%vs1%）。

科學家們認為，出現這種現象的原因是許多致癌突變與癌症類型有關，很多癌種發病率較低，因此在該癌種中致癌基因出現頻率再高，放到泛癌種中也並不是舉足輕重的地位了。

常見突變基因的鑑定對於藥物開發起着重要作用，未來，該研究或可為相關藥物研發提供一定思路。