陳根：我國“超算抗疫”，入圍“戈登貝爾特別獎”_風聞

文|陳根

戈登貝爾獎（GORDON BELL PRIZE），設立於1987年，主要頒發給高性能應用領域最傑出成就，通常由當年TOP500排行名列前茅的計算機系統的應用獲得，被稱為“超算領域的諾貝爾獎”，具有較大國際影響力。

美國、日本兩大超算強國壟斷該獎項長達近30年。在HPC China 2019上，清華大學計算機系教授鄭緯民曾總結獲得該獎項兩個最基本的條件：第一，應用程序在TOP500前幾名機器上全機運行；第二，應用程序有很好的性能。

中國超算第一次世界排名第一，是2010年11月的“天河一號A”。然而，硬件水平只是基本要素之一。正所謂“硬件搭台、軟件唱戲”，戈登貝爾獎要求，應用程序要在頂級的硬件的舞台上唱出精彩的戲才行**。**

由於新冠疫情的暴發，美國計算機協會（ACM）於2020年首次設立了戈登貝爾獎新冠特別獎（ACM Gordon Bell Special Prize for HPC-Based COVID-19 Research），以表彰在“超算抗疫”方面取得的傑出研究成果，2020年該獎項有6項成果入圍，全部被美國包攬。

好消息是，近日，位於天津經開區的國家超級計算天津中心聯合國防科技大學計算機學院、海南大學藥學院、中山大學藥學院、中國海洋大學醫藥學院、美國肯塔基大學藥學院等單位，在天河新一代超級計算機上完成的“基於自由能微擾-絕對結合自由能方法的大規模新冠藥物虛擬篩選”工作，成功入圍2021年度的戈登貝爾新冠特別獎，這是我國首次入圍該特別獎獎項。

科學家們以新冠病毒的M-Pro和TMPRSS2等重要靶點為研究對象，對來源於美國FDA（食藥監局）批准上市及成熟商業庫的近180萬種小分子與靶點的複合物進行計算評價，在一週內完成了50餘萬個複雜分子動力學模擬任務，並篩選出98個化合物，其中50個化合物在生物活性測試中表現出較高活性，命中率達到51%，是當前國際最高水平。

根據實際測算，在天河新一代超級計算機的支撐下，**基於自由能微擾-絕對結合自由能方法的藥物篩選效能提升了200倍。**未來，該項成果對於突發疫情的快速藥物響應，具有十分重要的作用。