不穩定的Omicron變異株是以犧牲適應性為代價的？希望如此_風聞

【本文由“靈瑾”推薦，來自《世衞組織：全球已有77個國家和地區出現奧密克戎毒株，幾星期後此輪疫情可能將達到頂峯》評論區，標題為小編添加】

筆者注：因Omicron疫情及其研究進展，本文對2021-12-15原文作了補充和個別修改

下面圖1是美國CDC官網https://covid.cdc.gov/上的Omicron（B.1.1.529）分佈地圖（2021.12.15）有76個國家報告了Omicron。

下面圖2是全球病原體實時跟蹤網https://nextstrain.org/ncov/gisaid/global上的全球新型冠狀病毒基因組二次抽樣的2020年、2021年發育樹（圖中放不下2019年的），左上角不同顏色標註了COVID的不同分支，Omicron是大紅色，在分支圖中下方最右端。

下面圖3是omicron子分支放大圖，21M(omicron)先後有兩個分支：21K(omicron)和21L(omicron)。分支21K(omicron)最早的一株是2021-11-16由南非豪登Stellenbosch大學實驗室提交，有94個核苷酸突變。最後幾株是在2021-12-17，其中一株是莫桑比克國立沙特實驗室（INS）提交的，有98個核苷酸突變。21K(omicron)全部毒株均屬於BA.1譜系（血統），傳染力較強但毒力較弱，病症多為輕型和無症狀，被稱為COVID的“温和”版本，至12月19日在英國出現12例死亡。

​科學家在2021-12-26首次檢測到了omicron的一個新的亞種分支21L(omicron)，被稱為“偷偷摸摸”的BA.2新譜系，它由卡塔爾大學/卡塔爾基因組計劃（QGP）實驗室提交，有119核苷酸突變。最新出現是在一株是2022-01-16，由印度加德滿都大學醫院杜利赫勒醫院實驗室提交，有127核苷酸突變。

BA.2譜系的特徵是，雖新出現了許多BA.1沒有的核苷酸突變，但同時又放棄了BA.1的一些核苷酸突變（詳見https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/367），重要的是放棄了BA.1獨特的S基因缺失突變（S-gene dropout mutation ）這使得常規的核酸檢測不容易發現它，因而難以基於常規的聚合酶鏈反應或聚合酶鏈反應來對它進行評估，所以加州大學聖地亞哥分校的遺傳學家Niema Moshiri告訴《每日野獸》記者説“使用原來的阿爾法病毒測試來尋找Omicron的實驗室技術人員可能會錯過BA.2病例”。

目前科學家正在積極探究Omicron可能的繼續突變將如何影響新冠疫。對人體免疫的選擇壓力迫使病毒產生適應性突變而生存。希望如德國病毒學家Meyer所指出的那樣，不穩定的Omicron的突變是以犧牲適應性為代價的。病毒一旦失去了免疫選擇壓力，則會發生向野生型（wild type）反向突變(reverse mutation )，這些變體有可能成為大流行後的一種新常態，像普通流感一樣。

倫敦衞生和熱帶醫學學院的流行病學家Adam Kucharsk説：病毒引發新流行病的最簡單方法，是隨着時間的推移逃避免疫，這與我們看到的季節性冠狀病毒相似。病毒逃避免疫和降低傳染性的進化路徑，在流感等已有的呼吸道病毒中很是常見。西雅圖弗雷德·哈欽森癌症研究中心的進化生物學家Jesse Bloom則明確表示：Omicron的崛起表明它已經找到了逃避人類免疫的方法，這種新的病原體不會被根除，相反，它將與在人類中傳播了幾十年、導致相對輕微感冒的四種“季節性”冠狀病毒並存，從而成為第五種在人類中永久存在的冠狀病毒地方性疾病。（詳見https://www.nature.com/articles/d41586-021-03619-8）

歐洲是Omicron重災區。據歐盟CDC官網https://www.ecdc.europa.eu/2021年12月19日報道，歐盟/歐洲經濟區28個國家報告了確診Omicron病例總數4691例，所有病例都是無症狀或輕微的。Omicron從2021年12月初入侵美國，三週內就佔據了總病例的73.2％，使得美國確診病例大幅上升。

現在Omicron已經肆虐一個月了，下面兩圖分別是的歐州和美國每日確診病例和死亡病例的7天平均值曲線（https://ourworldindata.org）。總體可見，與Delta病毒相比，Omicron表現出了傳播快、感染多，但病症輕、死亡少的疫情特徵，映證了上述的預測。這從病死率（=累計死亡/累計確診*100**%）可以看出，Omicron出現這一個月來，歐洲病死率從1.79%降到1.36%，美國病死率從1.57%降到 1.21%** ,全球病死率從1.93**%降到 1.57%。**