中科院研究：新冠病毒的起源符合自然進化過程

通過病毒的基因突變，可以推測其歷史宿主？

8月31日，記者從中國科學院遺傳與發育生物學研究所獲悉，該所研究人員提出了一種新的新冠病毒溯源策略，即通過鑑定新冠病毒基因突變的頻譜特徵來推測新冠病毒的歷史宿主。

論文截圖

研究發現，新冠病毒在疫情暴發前積累的突變特徵與野生蝙蝠（尤其是菊頭蝠）細胞環境高度相符，也就是説新冠病毒的起源符合自然進化過程。研究為新冠病毒的自然起源提供了公開透明和實證性的數據支持。相關研究成果在線發表於綜合性英文學術期刊《The Innovation》。

目前，研究發現的與新冠病毒基因組序列最相近的是從菊頭蝠屬分離得到的蝙蝠病毒RaTG13，它的基因序列與新冠病毒的相似性僅為96.2%。“蝙蝠病毒RaTG13與新冠病毒的進化分歧大約發生在50年前。根據進化分析，直到疫情暴發前，新冠病毒已經積累了500多個突變。”論文共同通訊作者、中科院遺傳與發育生物學研究所研究員錢文峯説。

鑑於此，研究人員提出了利用新冠病毒這500多個突變的頻譜特徵推測新冠病毒歷史宿主的溯源策略。

研究人員首先確認了這一策略運用所需要滿足的前提假設。“我們需要確認三個前提假設：一是細胞環境在不同宿主之間存在差異，會在其攜帶的病毒基因組上產生宿主特異性的突變；二是病毒基因組的新生突變主要是由宿主細胞環境造成的；三是病毒在進化中積累的突變特徵主要是由新生突變決定的。”錢文峯解釋道。

中國科學院遺傳與發育生物學研究所官網

在建立了新溯源策略的理論基礎後，研究人員構建了非典病毒、中東呼吸綜合徵病毒、新冠病毒以及與其相關的16種冠狀病毒的進化樹。錢文峯指出，這些病毒都是其他研究人員以往從人、蝙蝠、駱駝、果子狸、穿山甲和刺蝟等不同物種中分離得到並進行過測序的。

“通過鑑定這些病毒進化歷史上不同時期積累的突變，我們發現，來源於不同宿主的病毒帶有不同的突變特徵。宿主物種的差異越小，病毒的突變特徵越相似。”論文共同通訊作者、中科院遺傳與發育生物學研究所副研究員郇慶説，這一結果確認了根據病毒突變特徵推測其歷史宿主這一計算生物學策略的可行性。

為了推測新冠病毒的進化歷史，研究人員對新冠病毒在這段時間產生的突變特徵開展了分析，發現新冠病毒在疫情暴發前積累的突變特徵與野生蝙蝠（尤其是菊頭蝠）細胞環境高度相符。“也就是説新冠病毒的起源與自然過程相符，這為新冠病毒的自然起源提供了公開透明和實證性的數據支持。”郇慶解釋道。

（科技日報記者 陸成寬）