人類病毒組多樣性變化模型發表
科技日報昆明5月9日電 (記者趙漢斌)作為人類微生物菌羣的重要組成部分,病毒大量存在於人體口腔、皮膚、肺、胃腸道、血液甚至腦脊液中。記者9日從中科院昆明動物研究所獲悉,該所計算生物與醫學生態學組利用最新成果,建立了人類病毒組多樣性變化模型。
病毒幾乎遍佈地球的每個角落。在人體中,它們以病毒羣落形式存在,這些病毒羣落的集合即為人類病毒組。
“與腸道菌羣中的細菌相比,病毒數量是細菌的10倍以上,可高達萬億。人類病毒羣落包括內源性逆轉錄病毒、感染人類細胞的真核病毒、感染細菌的噬菌體和感染古菌的病毒。”學科組負責人馬占山研究員介紹説,人體病毒羣落與宿主間存在協同進化,因而存在着複雜的相互作用。
現有研究發現,人體病毒組與許多疾病間存在着緊密的聯繫,疾病可能會影響病毒組的多樣性及其組成;同時,病毒組的改變也會反過來影響疾病的發病與進程。這些疾病不僅包括如艾滋病、埃博拉出血熱和流行性感冒等由病毒感染直接引發的病毒源性疾病,還包括如囊性纖維化、牙周疾病、炎症性腸病等非病毒源性疾病。近期,學科組博士生肖琬蒙應用馬占山提出的“多樣性—面積關係”分析方法,首次獲得了人類病毒羣落多樣性在個體間的異質性、羣體水平的潛在多樣性,以及局部病毒羣落多樣性在全球病毒宏羣落中所佔的比值,並探究了疾病對這些參數的影響。
該模型顯示,通常疾病對人類病毒羣落在個體間多樣性異質性的影響並不顯著,反而潛在病毒多樣性在健康對照組與患者間可能存在顯著差異。同時,上述比值參數、人體病毒羣落的比值參數要遠大於細菌羣落。
研究結果提示,儘管我們體內病毒個體數量是細菌數量的10倍,但從羣體角度看,每個人對全球病毒多樣性的貢獻,反而要比對細菌多樣性的貢獻高。國際期刊《遺傳學前沿》在線發表了這一研究結果。