Nature Microbiology:Ct值大於35時,是否還有傳染性?_風聞
皮皮蟹的忧桑-2022-05-18 09:11
轉載自公眾號“華山感染”
病毒感染是個相當複雜的過程,病毒的複製和清除均受到宿主和病毒相互作用的影響。認識病毒複製和清除的動態過程,對制定有效的隔離、篩查和檢測等公共衞生方案具有重要的作用。

2020年秋天至2021年春天,伊利諾伊大學厄巴納-香檳分校(UIUC)對校內職工和學生進行了至少每週2次的SARS-CoV-2的PCR檢測,共納入了60例符合入選標準的受試者,即納入研究7天前SARS-CoV-2的PCR結果陰性且24小時內檢測結果陽性或5天內與陽性患者有密接接觸史。對受試者進行了連續14天的鼻拭子和唾液採樣,描述每個受試者的病毒動態變化過程。研究同時進行了抗原檢測和病毒分離培養。研究結果在Nature Microbiology上進行了發表。

研究結果顯示,絕大部分的病例中,病毒載量在鼻拭子或唾液樣本中都出現了升高和下降的動態變化。大部分患者在發病12天后鼻拭子和唾液樣本的病毒Ct值介於30-40之間,所有標本的病毒分離培養從第9天開始不能分離出病毒,提示此時病毒已不在具有傳染性。約有93%的受試者在病毒分離培養陽性時同時抗原檢測陽性。

**圖1. SARS-CoV-2每日檢測的動態變化。****a.**唾液標本(藍綠色點)qPCR結果,鼻拭子標本(藍色點)qPCR結果,鼻拭子病毒分離培養(紅色叉)和抗原陽性標本(深黃色填充)。左側y軸代表唾液和鼻拭子標本的Ct值;右側y軸代表病毒培養結果。點狀垂直線代表鼻拭子Ct值最低的時間,短划水平線代表RT-qPCR和病毒培養的檢測下限。**b.**病毒培養陽性的不同時間點的Ct值。**c.**抗原結果。
該研究通過建立不同的數學模型,更全面地闡述了不同個體間病毒的動態變化差異。鼻拭子和唾液標本中病毒動態變化不同。鼻拭子樣本中,病毒載量在達到峯值後快速下降,而後速度逐漸減慢。唾液標本中,病毒載量在達到峯值後的下降速度較鼻拭子標本有所減慢。研究計算了鼻拭子和唾液標本中,病毒載量從感染到峯值的平均時間分別為4.9天(±0.5天)和3.9天(±0.8天),病毒載量從峯值到檢測下限的平均時間分別為22.3天(±8.3天)和14.9天(±3.2天)。

圖2. 唾液標本(藍綠色點)和鼻拭子標本(藍色點)的RT-qPCR結果的擬合曲線。
研究進一步評估了病毒的傳染性,qPCR的Ct大於35時,樣本不再分離出傳染性病毒;Ct值大於28時,感染者基本無病毒脱落。

**圖3. 不同個體傳染性病毒脱落的異質性。****a.**鼻拭子病毒培養陽性的天數分佈。**b.**年齡和病毒培養陽性天數的標準線性迴歸分析。**c.**Ct值和病毒培養陽性概率的相關性。**d.**Ct值與傳染性病毒脱落的相關性。**e.**感染過程中經鼻腔排出的傳染性病毒的預計總累計水平分佈。**f.**年齡與預計傳染性病毒總體脱落的關係。
受限於研究時間,該研究並未包括目前正在流行的奧密克戎毒株,但是針對Alpha突變株(B.1.1.7)和之前流行的非VOC突變株的動態監測,對公共衞生措施的制定具有非常重要的參考意義。