Omicron年終天梯榜_風聞

以2022年第四季度內上傳的全球測序為數據，設置國內流行的BF.7為基線(Baseline)，以相對基線的增長優勢(Relative Growth Advantage)的置信區間下限(Confidence Interval Lower Boundary)倒序排列，得到了益生菌19的年終的天梯榜。

關於命名的簡介

謹防歲月史書，順便介紹一下PANGOLIN等命名法 評論 2 國際

關於相對增長優勢、有效再生數Rᵗ、“階”的概念請見

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對比兩個多月前的天梯榜

新冠這事可沒有“早得早解脱”的説法，看看這個進階表吧 評論 58 醫療

本月出現了大量高階的新被Pango命名的Omicron變種，已經正式進入8階的時代了。而被設置為基線的BF.7僅僅是4階。需要指出的是，“相對增長優勢”僅僅考慮了刺突蛋白的受體結合域(RBD)中的12個被認為有增強免疫逃逸能力的位點，作為判斷一款變種是否具備造成大流行的能力的前提條件之一，另外一個需要考慮的是與ACE2受體的親和能力(Binding Affinity)。通常認為一款變異株的受體親和力如果得到了提升，則它在人體內的突變能力和致病性都會隨之上升。

阿肯色州立大學的Raj Rajnarayanan教授做的免疫逃逸與hACE2親和力的預測

縱軸為相對增長優勢，橫軸為相對hHCE2親和能力

如圖，增加了hACE2親合能力的橫座標後，大致可以知道一款變種的傳播能力。此圖以BA.2為基線(座標的原點)，縱座標為一款變種相對於BA.2的增長優勢，橫座標為一款變種相對於BA.2的hACE2親和能力，圖中紅線為國內流行的四階BF.7，屬於中不溜水平。藍色圓圈(大約座標0.7,0.6)為五階的BQ.1，橙圈(大約座標0.8,0.8)為進了一階後的BQ.1.1。圖中的右上都是潛在的毒王。由於Jesse Bloom老師在發論文的時候只設定到了7階，所以以他的論文數據建模的縱軸在超過7階以後就不太準確了，否則XBB家族應該能再拔高一些位置。另外，由於增加了橫軸後不確定的因素也隨之上升，所以這個圖僅供參考。雖然此圖未必準確，但多少可以解釋第一款進入8階的XBB.4.1(左上角)為什麼沒有能夠流行開：它的受體親和力不夠好。

和兩個多月前相比，益生菌19趨同演化的大勢並沒有太多的變化，基本上仍然是XBB和BQ家族的競爭為主線，其中剛剛被分配名稱的DP.1(BQ.1.1.8.1)由於測序較少的關係出現了非常誇張的相對增長優勢，靠着統計學上的誤差(當然也不排除它真的就有這麼強)，佔據了年終天梯榜的榜首。佔據了北美西海岸、歐洲和非洲的BQ家族在全球各地的增長勢頭正在被XBB超過。佔據了北美的東海岸的XBB還在南亞次大陸上發展出了龐大的譜系。進入8階的XBB.1.5現在是北美增長勢頭最猛的一款，現在壓力來到了據守西海岸的BQ家族。

另一款重組株，XAY家族的測序數量和分支數量都開始爬升，這是一款BA.2與Delta家族的AY.45的重組株，此類德奧合流的毒株通常叫做“德爾塔克戎(Deltacron)”。在南非首先檢出的XAY已經在歐洲出現了分化，最新的幾個分支的增長優勢也很可觀。

需要注意的是土澳的XBF，這是BA.5.2.3與CJ.1(BA.2.75.3的分支)的重組株，可能是一款兼具高增長優勢和高hACE2親和力的毒株，由於樣本偏小且暫時未在其它地區大量出現，故這一點尚不能石錘，但是無論XBB還是BQ在土澳確實沒能壓過XBF的增長勢頭，而土澳的住院人數最近也在創造新高。

此外還有同為BA.2.75.3的分支BM.4的分支CH.1，已經開始在歐洲和新西蘭爬升，且出現分化的跡象，不過它是否能與XBB和BQ家族的高階新鋭們競爭還是個未知數。