Transcripta Bio(Rarebase)利用人工智能研發罕見疾病藥物 - 彭博社
Ashlee Vance
在Transcripta Bio,自動化機器人用於高通量藥物篩選。
攝影師:丹尼爾·拉爾森
照片插圖:731;攝影師:Jutharat Pinyodoonyachet為彭博商業週刊;YouTube在過去六年裏,凱莉·裏奇經歷了一段沒有父母希望經歷的旅程。她的女兒患有由一種罕見基因病引起的自閉症,裏奇迫切希望幫助她應對這種基因異常的影響。這使得女孩無法説話,削弱了她像7歲同齡人一樣移動和互動的能力。“我與全球的研究人員、科學家、學者、企業家、慈善家、投資者和父母進行了交談,”裏奇説。“我的意思是,任何願意與我交談的人。我真的希望能找到一個能引導我朝積極方向前進的人。”
彭博商業週刊連任的特朗普能做什麼和不能做什麼來影響美聯儲這種臨牀護膚方案是38年研究的成果塑造美國選舉的搖擺州經濟現實內特·西爾弗想教你如何成為更好的賭徒裏奇大多數時候遇到的都是壞消息。她發現一些處於類似境況的家庭因虛假的希望而破產或分崩離析。幾乎沒有跡象表明某種療法可能在未來為她的女兒提供幫助。但去年,加利福尼亞的一組科學家開發了一種新的藥物篩選程序,發現了一種他們認為可能幫助裏奇女兒的藥丸。這個孩子在12月開始服用這種藥丸,早期跡象表明它正在起作用。
“她在某些方面變得更加反應靈敏了,”Rich説。“她有一架她喜歡彈的電子鋼琴,開始自己把它插到牆上。之前她對插電這件事沒有任何意識。”
“讓我感動的是,當她在沒有任何提示的情況下重複説‘我愛你’時。她一直是無言的。能夠把三個詞組合在一起,而且這三個詞組合在一起,真是讓人心都融化了,”Rich説。
Rich提供:Carrie Rich根據美國國立衞生研究院的資料,全球約有4億人患有 罕見疾病,這被定義為影響不到20萬人口的任何疾病。目前已知有1萬種這樣的疾病,其中三分之二影響兒童,使得追求任何類似於正常生活的事情變得不可能。(約30%的罕見疾病兒童活不過10歲。)但是,儘管有數百萬人需要治療,處理每種疾病的人數相對較少,使製藥公司的經濟計算變得複雜。製藥公司通常拒絕投資於罕見疾病的研究、開發和臨牀試驗,因為他們認為無法賺到足夠的錢來證明這些開支是合理的。
Transcripta Bio成立於四年前,決定將罕見疾病作為其主要業務。這家公司總部位於硅谷,開始逐一與家庭合作,尋找各種疾病的潛在遺傳原因以及可能有幫助的藥物。Transcripta的發現之一就是Rich的女兒正在服用的藥物。
Transcripta表示其技術具有更廣泛的意義。得益於DNA測序機器、藥物篩選技術和機器學習軟件的進步,它開發了一種系統,可以查看市場上已有的數千種藥物,並預測它們是否可能緩解各種疾病。該公司,前身為Rarebase PBC,在製藥界規模微小。它獲得了約3000萬美元的資金支持,包括一輪新的1000萬美元投資,正在努力證明其技術並尋求新的療法。
多年來,研究人員設法揭示了許多罕見疾病的根本原因。大約五分之二的疾病可以追溯到個別基因的異常,更多的則是由於少數非典型突變造成的。(Rich的女兒缺失了兩個基因的一半遺傳密碼。)這些數據,其中大部分是免費提供的,成為Transcripta藥物發現的基礎。
該公司首先使用軟件標記有前景的化合物,然後在實驗室培養的人類細胞上進行測試。在實驗室中,觀察藥物增強或抑制的基因,Transcripta試圖確定這樣做是否可能緩解一種罕見的遺傳疾病。
這種技術本身並不新穎。製藥公司通常專注於他們試圖解決的疾病,並進行試驗以檢查他們的藥物是否對與該疾病相關的基因有效。然而,他們通常不會超出這一關注領域,儘管藥丸和注射通常會影響數十到數百個其他基因。
在過去幾年中,進行測序操作和相關實驗以尋找這些額外效果的成本大幅下降。大約200萬美元的實驗室成本,Transcripta可以對所有已知的罕見遺傳疾病進行篩查。這個價格與傳統制藥公司直到最近僅僅為了開始研究針對單一疾病的單一藥物所支付的費用相似。Transcripta表示,Rich為她女兒的治療支付了公司的費用,但拒絕透露具體價格。
“現在資本效率更高了,”Transcripta的首席執行官兼首席科學官Chris Moxham説。“這不僅僅是一次針對一種疾病。我們將擁有一個包含數百個項目的組合。”(一些導致成本突破的基礎研究技術在一篇2018年的論文中有所介紹。)
迄今為止,Transcripta的方法已經發現了五種有潛力治療其他疾病的藥物,公司正在與患者及其醫生合作以測量其效果。美國政府通常對實驗的容忍度更高,當一種藥物之前被認為是安全的,並用於治療幾乎沒有其他選擇的嚴重疾病時。
Transcripta並不是唯一採取這種方法的組織。例如,Perlara PBC和Every Cure也有類似的目標和技術。今年早些時候,非營利組織Every Cure獲得了來自美國高級研究項目局的4830萬美元的三年合同,旨在“釋放現有藥物治療更多疾病的全部潛力。”
Moxham對Transcripta的雄心不僅限於將現有藥物重新用於其他疾病。他表示,公司將與製藥公司合作,分析那些未能完全通過臨牀試驗的化合物,以查看這些化合物是否可能對其他疾病提供之前未曾預見的治療。他還打賭Transcripta的技術將幫助設計全新的藥物。
“在我們收到初步篩選的數據之前,我們並不知道這個平台的可能性,”Jazz Venture Partners的投資者John Lee説,該公司向Transcripta投資。“我們在不同的事物上看到了如此多的成功。這讓我們有信心可以追求比罕見疾病更大規模的適應症,以及影響數百萬人的事物。”到目前為止,Transcripta專注於神經系統疾病,但它正在迅速擴展,開始關注皮膚、眼睛和心臟疾病。
對於Rich來説,接下來的幾個月將對確定新治療對她女兒的有效性至關重要。最近的血液測試確認該藥物在孩子體內加速了某些過程,這些數據也補充了Rich在家中和她女兒在學校的老師所做的觀察。“我們的希望和願望可能看起來相當簡單,”Rich説。“但我們希望我們的孩子能夠表達自己的需求,為自己發聲,講述自己的故事。”
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