諾獎得主涉嫌造假，被撤回了13篇PNAS等高水平文章_風聞
熊猫儿-1小时前
2019年，諾貝爾生理與醫學獎聯合授予William G. Kaelin Jr、Sir Peter J. Ratcliffe和Gregg L. Semenza，以表彰他們“對細胞感知和適應氧氣供應的發現”。
近期，Gregg L. Semenza被質疑多篇論文涉嫌學術不端，Pubpeer已經掛了他52篇論文。
這些被質疑涉嫌學術不端的論文，時間跨度從2001年到2021年，論文發表的期刊包括Science Signaling、Cell Reports、Journal of Biological Chemistry、PNAS、Cell Metabolism、Cancer Research、JCI 等期刊。
這些被質疑的論文所涉及的學術不端，主要是一圖多用，圖片PS等。目前僅有少數幾篇被質疑論文得到作者回應，作者回應稱“論文中無意的錯誤並不影響實驗結論”。
截至2024年9月5日，Gregg L. Semenza至少糾正了6篇文章，撤回了13篇文章：包括Gregg L. Semenza撤回了1篇Molecular Cancer Research，2篇Cancer Research（2024年9月4日被撤回2篇），5篇PNAS ，1篇Oncogene****，3篇Journal of Biological Chemistry****，1篇Biochemical Journal****。********
1.Collagen Prolyl Hydroxylases Are Essential for Breast Cancer Metastasis
應作者的要求，這篇文章已被撤回。在幾位作者的主要合作伙伴約翰霍普金斯大學的機構審查之後，確定在圖1B中，HIF-1α Western blot的5和7泳道被複制，P4HA1 Western blot的5和7泳道被複制。此外，正如之前在編者注(2)中發表的那樣，代表HIF-1α、HIF-2α和肌動蛋白的Western blot條帶也被作者在2012年Oncogene發表的圖1A中使用(3)。作者向科學界道歉，並對因發表和隨後撤回這篇文章而造成的任何不便或挑戰深表歉意。
這份撤稿通知的副本被髮送到九位作者中八位最後已知的電子郵件地址。三位作者(Daniele M. Gilkes、Denis Wirtz和Gregg L. Semenza)同意撤回論文；五位作者(Pallavi Chaturvedi、Saumendra Bajpai、Carmen C. Wong、Hong Wei和Maimon E. Hubbi)沒有回應；剩下的一位作者(Stephen Pitcairn)去世了。
2.PHGDH Expression Is Required for Mitochondrial Redox Homeostasis, Breast Cancer Stem Cell Maintenance, and Lung Metastasis
應作者的要求，這篇文章已被撤回。經過幾位作者的主要合作伙伴約翰霍普金斯大學的機構審查，確定在圖7F中，代表M1-sh2和M2-sh2的圖像具有連續特徵，表明這些圖像可能來自同一只小鼠。此外，某些原始數據被標記為來自M2-sh2和M3-sh2小鼠，但也具有連續的特徵，這表明這些數據也可能來自同一只小鼠。作者對數據的完整性沒有信心，他們向科學界道歉，並對因發表和隨後撤回本文而造成的任何不便或挑戰深表歉意。
這份撤稿通知的副本已發送到所有六名作者最後已知的電子郵件地址。兩位作者(Daniele M. Gilkes和Gregg L. Semenza)同意撤回論文；其餘四位作者(Debangshu Samanta, Youngrok Park, Shaida A. Andrabi和Laura M. Shelton)沒有回應。
3.Procollagen Lysyl Hydroxylase 2 Is Essential for Hypoxia-Induced Breast Cancer Metastasis,Molecular Cancer Research
應作者的要求，這篇文章已被撤回。作者發現圖3A中HIF-1α免疫印跡的4、5和6泳道是相同的圖像。內部審查證實了作者的説法，編輯同意了作者的撤稿請求。作者向科學界道歉，並對因發表和隨後撤回這篇文章而造成的任何不便或挑戰深表歉意。
本撤回通知的副本已發送到所有作者最後已知的電子郵件地址。四位作者(Denis Wirtz、Carmen C. Wong、Daniele M. Gilkes和Gregg L. Semenza)同意撤稿;其餘3名作者無法找到。
4.HIF-1-dependent expression of angiopoietin-like 4 and L1CAM mediates vascular metastasis of hypoxic breast cancer cells to the lungs,Oncogene
作者已經撤回了這篇文章，因為在這篇文章中已經注意到多個圖像的不規則性，具體來説:
圖1A，上面板(HIF-1a印跡)，5號泳道和7號泳道似乎是重複的。
圖6B，下面板(b-肌動蛋白印跡)，前六個通道似乎與圖6G，下面板(b-肌動蛋白印跡)相同。
圖3G, D10生理鹽水組第三隻小鼠的圖像與D21地高辛組第三隻小鼠的圖像相同。
5.Mitochondrial autophagy is an HIF-1-dependent adaptive metabolic response to hypoxia,Journal of Biological Chemistry
這篇文章已被作者撤回，除了F. Gonzalez不同意這一撤回通知，以及無法聯繫到J. B. Wesley。撤回的作者和期刊得出結論，
Figure 3B corresponding to the 20% lane in the ‘KO-EV’ panel.
Figure 4A presented background issues on the 20% lane of the ‘WT-EV’ panel.
In figure 8A, in the ‘Anti-Bcl2’ top panel a band in the ‘IgG’ panel, ‘WT, 20%’ lane was potentially artificially removed.
There were signs of duplication in the FACS plots in figure 9F. In supplemental figure S4, there were signs of potential splicing between lanes 2 and 3.
Supplemental figure S5 presented signs of background manipulation on lane 1 on ‘Anti-Bcl2’ top panel. In supplemental figure S6 ‘WCL’ panel on the left, the ‘Anti-Bcl2’ top panel presented artificially deleted bands on lanes 1, 2, 5 and 6.
In addition, in the ‘IP’ immunoblot panel on the right, lane 1 in anti-Flag top panel, the band was artificially removed.
The ‘Anti-Bcl2’ panel at the bottom presented signs of inappropriate manipulation.
提供的原始數據並不能解決這些問題。
6.Hypoxia-inducible factor 1 (HIF-1) promotes extracellular matrix remodeling under hypoxic conditions by inducing P4HA1, P4HA2, and PLOD2 expression in fibroblasts,Journal of Biological Chemistry
除了S. Bajpai和P. Chaturvedi未能聯繫上外，這篇文章已被作者撤回。
作者和期刊得出結論，
Figure 1 presented background issues on ‘FN’ panel, lane 1.
Figure 2B, ‘FN’ panel corresponding to ‘Conditioned media’ (bottom panel in the middle), lanes 1 and 4 were reused.
the top right panel for ‘ECM’, lanes 3 and 4 were reused.
‘Conditioned media’ top middle panel, lanes 1 and 4 were reused. Figure 3B ‘HIF 1a’ top panel, lanes 5 and 7 were reused.
supplemental figure S1 A, in ‘HIF1’ panel lanes 2 and 4 were reused.
supplemental figure S1 B, ‘HIF2a’ panel, lanes 1 and 3 were reused.
‘Actin’ panel lanes 3 and 4 were spliced in.
supplemental figure S1 B, ‘P4HA1’ panel lane 1 was spliced in, and lanes 4 and 6 were reused.
supplemental figure S1 B, ‘P4HA2’ panel, lanes 4 and 5 were reused.
supplemental figure S1 C, ‘HIF1a’ panel, lanes 3 and 4 were reused.
supplemental figure S1 D, ‘P4HA1’ panel on top left, lanes 1 and 2 are spliced together with lanes 3 and 4.
supplemental figure S1 D, ‘P4HA2’ top middle panel, lane 1 was spliced in.
提供的原始數據並不能解決這些問題。
7.Acriflavine inhibits HIF-1 dimerization, tumor growth, and vascularization,PNAS
署名作者指出:“由於圖2D底部面板的問題，我們撤回這篇文章。在這個印跡中，可以看到頂部的GST- hif -1β條帶，中間有一個微弱的雙重條帶，底部有一個遷移在GST上方的強條帶，這可能是GST- hif -1β的降解產物。在中間的雙線圖中，2、5、8泳道似乎是重複的圖像；泳道3、6和9是重複的圖像；泳道4和泳道7是重複的圖像。還有人擔心底部條帶顯示的數據可能被操縱。我們認為論文的總體結論仍然有效，但由於對數據的這些潛在擔憂，我們正在撤回這項工作。給您帶來的不便，我們深表歉意。”
8.Hypoxia-inducible factors are required for chemotherapy resistance of breast cancer stem cells,PNAS
對於“Hypoxia-inducible factors are required for chemotherapy resistance of breast cancer stem cells”文章，撤稿聲明指出：“我們正在撤回這篇文章，因為我們擔心一些已發佈的數據，我們認為這是在構建數據過程中選擇了錯誤圖像的結果。識別出正確的圖像，並且不需要新的實驗來糾正上述問題。這些更新的數據可以在 bioRxiv 上發佈的預印本文章中找到，“Enrichment of breast cancer stem cells following cytotoxic chemotherapy is mediated by hypoxia-inducible factors”（https://doi.org/10.1101/2022.06.27.497729）。**我們相信這篇論文的總體結論仍然有效，但由於對這些圖片的潛在擔憂，我們正在撤回這項工作。**我們對不便表示抱歉。”
9.Anthracycline chemotherapy inhibits HIF-1 transcriptional activity and tumor-induced mobilization of circulating angiogenic cells,PNAS;
對於“Anthracycline chemotherapy inhibits HIF-1 transcriptional activity and tumor-induced mobilization of circulating angiogenic cells”文章，撤稿聲明指出：“由於對圖 2 的擔憂，我們將撤回這篇文章。我們相信這篇論文的總體結論仍然有效，但由於對圖片的潛在擔憂，我們正在撤回這項工作。現在已經進行了驗證性實驗，結果可以在 bioRxiv 上發佈的預印本文章中找到，“Daily administration of low-dose daunorubicin or doxorubicin inhibits hypoxia-inducible factor 1 and tumor vascularization”（https://doi.org/10.1101 /2022.06.15.492526）。我們對不便表示抱歉。”
10.Hypoxia-inducible factors mediate coordinated RhoA-ROCK1 expression and signaling in breast cancer cells,PNAS;
對於“Hypoxia-inducible factors mediate coordinated RhoA-ROCK1 expression and signaling in breast cancer cells”文章，撤稿聲明指出：“由於對已發表的幾個數據的擔憂，我們正在撤回這篇文章。我們相信這篇論文的總體結論仍然有效，但由於對這些圖片的潛在擔憂，我們正在撤回這項工作。我們對不便表示抱歉。”
11.Mutual antagonism between hypoxia-inducible factors 1α and 2α regulates oxygen sensing and cardio-respiratory homeostasis,PNAS;
對於“Mutual antagonism between hypoxia-inducible factors 1α and 2α regulates oxygen sensing and cardio-respiratory homeostasis”文章，撤稿聲明指出：“由於對圖 5 的擔憂，我們正在撤回這篇文章。 我們相信這篇論文的總體結論仍然有效，但由於對這個圖片的這些潛在擔憂，我們正在撤回這項工作。現在已經進行了驗證性實驗，結果可以在 bioRxiv 上發佈的預印本文章中找到，“Homeostatic responses to hypoxia by the carotid body and adrenal medulla are based on mutual antagonism between HIF-1α and HIF-2α”（https：/ /doi.org/10.1101/2022.07.11.499380)，我們對不便表示抱歉。”
12.Activation of hypoxia-inducible factor 1 in human T-cell leukaemia virus type 1-infected cell lines and primary adult T-cell leukaemia cells,Biochemical Journal;
琉球大學的一項調查顯示，這篇論文中出現的圖片也曾在其他論文中使用，但沒有適當的歸屬或解釋(這種模式在不同期刊的許多出版物中重複出現)，Biochemical Journal雜誌的編輯委員會撤回了這篇論文。最後一位作者森直樹(Naoki Mori)對本文數據的錯誤表述承擔全部責任。
13.Endothelial expression of hypoxia-inducible factor 1 protects the murine heart and aorta from pressure overload by suppression of TGF-β signaling,PNAS ;
署名作者指出:“我們撤回這篇論文的原因是考慮到圖4F和圖4G中總ERK1/2和磷酸化ERK1/2的免疫印跡分析數據。第一個問題是，在圖4F中，使用了兩種不同的印跡來分析總ERK1/2和磷酸化ERK1/2，而在圖4G中，似乎相同的印跡被剝離並重復使用來分析總ERK1/2和磷酸化ERK1/2。第二個問題是，在圖4F中磷酸化ERK1/2的分析中似乎存在通道剪接，這在圖中沒有顯示。由於數據的完整性受到質疑，並且我們無法找到10多年前的原始數據文件，我們要求撤回這篇論文。對於由此造成的不便，我們深表歉意。”
這批被爆涉嫌造假的論文，其中存在的主要問題是：
1. 詬病最多的套路：一圖多用或圖片PS。
“Much more similar than expected”最常出現的評論。另一些圖片則被質疑使用了PS修圖大法。
2. 還有少數文章被質疑存在倫理問題。
這裏實驗鼠的腫瘤被質疑長得過大。
其他被質疑的數十篇論文情況類似，不再一一介紹，感興趣的讀者可以打開文末鏈接查看。
部分被質疑論文列表
