從發現到發表僅2年！他感慨：中國的科研“如此高效”_風聞

來源：微信公眾號“科學網”

文 | 《中國科學報》記者 王兆昱 見習記者 江慶齡

“一蓑煙雨任平生。”在讀到蘇軾的詞時，生物遺傳學家丹尼爾·法魯什（Daniel Falush）找到了知音，這句詩詞亦是他人生的真實寫照。

21年前，丹尼爾關於幽門螺桿菌基因組學的研究登上Science。多年來，他一直深耕此領域。

“中國的胃癌發病率較高，能否從細菌基因組學的角度找到原因？”2019年，丹尼爾從倫敦起飛，跨越重洋來到上海，成為中國科學院上海免疫與感染研究所的研究員。4年間，他組建起一支充滿活力的國際化團隊。

丹尼爾常感嘆，在中國做研究“很高效”。10月16日，Nature在線發表了丹尼爾團隊的最新成果。他們發現了一種與常見類型不同的幽門螺桿菌“生態種”，它常伴隨更嚴重的胃病。

這一研究，從發現到發表，僅用兩年時間。

丹尼爾（左一）與他的團隊。

發現獨特“生態種”

對大多數病原體來説，人類胃部是個“禁區”，強酸會將它們一一消滅。然而，幽門螺桿菌不僅能在胃酸中生存，還能潛入胃黏膜並迅速繁殖，甚至使胃部的細胞“叛變”，引發持續性炎症，最終成為胃癌的隱秘推手。

更可怕的是，幽門螺桿菌的感染往往在童年時發生。由於兒童的免疫系統不成熟，細菌更容易“紮根”，導致終生感染。

“自人類誕生以來，幽門螺桿菌就與我們同在，我們想找出其歷史的更多細節。”丹尼爾告訴《中國科學報》。

帶着這樣的“執念”，丹尼爾團隊聯合瑞典、日本的科學家，着力收集世界各地的幽門螺桿菌樣本，甚至前往人跡罕至的偏遠地區採樣。從寒冷荒蕪的西伯利亞，到“與世隔絕”的美國原住民社區，都留下了他們的足跡。

“功夫不負有心人”，他們彙集了一個相當廣泛的全球樣本，共包含近7000個幽門螺桿菌基因組。

在此基礎上，研究人員發現了一組非常有趣的菌株。此菌株與常見類型不同，存在於北美、西伯利亞、智利的一些土著羣體中。他們將其命名為“hardy”，寓意為“耐寒的”。

“這是一種不尋常的‘生態種’。”丹尼爾解釋道，“生態種指同一物種內，因適應不同生態環境，而在基因上表現出微小差異的種羣。”

Nature官網論文截圖。

研究人員推測，幽門螺桿菌在人類早期、走出非洲之前就分裂為兩種“生態種”，並隨着人類的遷徙在全球傳播。

隨着進一步研究，丹尼爾團隊還在老虎、獵豹等大型貓科動物（食肉動物）的胃部發現了hardy菌株的“身影”。

他們大膽提出假設：hardy菌株可能與愛吃肉的飲食習慣相關。證據是hardy菌株發展出了基因的“第二版本”，編碼了額外的依賴鐵的尿素酶，以幫助它們適應食肉動物更酸的胃。但該假設尚未經過驗證。

此外，帶有hardy菌株的人通常患有嚴重的胃病，胃癌發病率很高。“但尚未證實hardy類型有更強的攻擊性。我們希望在不遠的將來找到答案，並助力設計更好的治療方法。”丹尼爾説。

中國科研：“很高效”！

丹尼爾坦言，早先也有學者注意到hardy菌株的存在，但丹尼爾團隊不僅發現了這一“生態種”，還詳細闡明瞭其背後的進化歷史，“我們提出了完整的進化假説，並用大量的證據加以支持” 。

“多年來，我們一直收集並分析幽門螺桿菌的數據，建立起很好的科研聲譽。”回憶起過去，丹尼爾的語氣中透着一絲自豪。

2022年10月，團隊發現了hardy菌株，大家無不為此感到振奮。經過數月的研究，他們撰寫了論文，並將其公佈在預印本平台bioRXiv上。如今，論文已在Nature上順利發表。

談及在中國的科研體驗，丹尼爾總結為3個字——“很高效”。來到中國以後，在中國科學院的支持下，他迅速組建起一支強大的團隊。

事實上，在來中國之前，丹尼爾就已經與中國的科研人員有合作，這為他日後組建團隊打下了良好的基礎。如今，他的研究團隊呈現出兩個顯著的特點：“金字塔”結構和國際化。

“我們的團隊像一座金字塔。”丹尼爾解釋道，除了他本人外，團隊還有兩個“中堅力量”——青年研究員薩拉·斯文森（Sarah Svensson）和楊超。他們經驗豐富，能夠獨立帶領項目，這大大提高了整體效率。其他成員也可以隨時和他們討論。

（從左至右）丹尼爾、薩拉、楊超。

國際化同樣是團隊的一大優勢。丹尼爾認為，國際化不僅提升了每個人的英語水平，還有助於大家學習不同的科研風格和思維方式。

“找到內心的自由”****

丹尼爾對科研的態度直率而篤定。雖然他已經在Science和Nature這樣的頂刊上發表了6篇論文，但他不認為頂刊能代表頂尖的研究。他相信，好的科研不一定要在知名期刊上發表，而是要有實質性的貢獻。對生物學領域來説，特別關鍵的是數據分析方法上的創新。

丹尼爾告訴《中國科學報》，有許多外國教授痴迷於“卷”論文數量，但他更在意科研的質量。“不會執着於許多項目，或多多益善地發表論文。我更看重一個好點子、一篇好論文的價值。”丹尼爾微笑着説。

丹尼爾。

除了科研，丹尼爾還很快融入了上海的生活。他成為廣場舞圈中的“靈魂舞者”，跳起舞來恣意瀟灑，不拘一格。他會拍下自己與中國阿姨們共舞的動圖，做成表情包，每當所裏有其他研究人員發了論文，就將表情包發在羣裏，以表慶祝。

‍丹尼爾跳舞動圖。

“Find inner freedom（找到內心的自由）”，這是丹尼爾的座右銘，也貫穿了他的人生選擇和科研追求。

“我在英國遇到了各種職業上的挫折，但在中國，我找到了新的機會。”丹尼爾説。每年夏天他會回到英國陪伴家人，但大部分時間還是沉浸在上海的工作和生活中。

在快節奏的生活中，丹尼爾努力保持內心的自由。工作累了，他會暫時放下，“給自己放個假”，睡個懶覺。但即便是在休息時，他的思緒也從未停止。在走路甚至跳舞時，他常常思考不同的科研問題。

丹尼爾對中國充滿了熱情和好奇，是個“中國通”。他去過中國的6個省份遠足，攀登過一座5000米的高峯。“我喜歡中國的鄉村，尤其是西部，那裏的人們以更傳統的方式生活，卻更加輕鬆和奔放。‍”丹尼爾説。

對於學生，丹尼爾並不強求他們為科研投入過多的時間，他希望學生的動力來自內心。“他們需要做足夠的工作才能畢業，但更重要的是，要從中找到自己的興趣點。”在丹尼爾看來，科研的迷人之處在於長期的、逐步深入的探索。

“當你投入得足夠深，事情就會開始變得有趣。”他説，幽門螺桿菌的研究正是如此——每一個細節、每一次發現都帶來新的驚喜。

團隊就像大家庭。

在中國的這些年，他發現中國學生做事高效認真，但不太擅長找到自己的科研方向；而西方學生常常有自己的想法，但可能並不是好的想法。丹尼爾期待，下一代年輕人能夠平衡好中西方學生的優缺點。

丹尼爾給學生的建議是：發展自己的興趣，尤其是參加更多體育鍛煉。“我認識很多優秀的科學家，都有健康的體魄。”有時，丹尼爾會拉着自己的學生去跳舞。

對於中國社會一些不好的現象，丹尼爾也大膽開麥：“比較文化在中國相當普遍，我不喜歡它。它經常讓人感到困惑——真正的目標是什麼？”

在採訪的最後，丹尼爾分享了一則軼事：亞歷山大·格羅滕迪克被譽為“20世紀最偉大的數學家”，他的童年在躲避納粹迫害中度過。他沒有接受過正統的學校教育，而是生活在森林裏，與大自然和動物為伴。

丹尼爾對此深有感觸。雖然他的經歷與格羅滕迪克不同，但他也在跨越重洋的科研旅途中找到了自己的“內心自由”。正是在不斷打破外在限制的過程中，真正的創新和突破得以產生。

論文鏈接：

https://doi.org/10.1038/s41586-024-07991-z