幽門螺桿菌，比我們想象的更古老_風聞

人類胃內極強的酸性環境能消化絕大多數食物，甚至分解鐵釘。然而，幽門螺桿菌不僅能夠在胃酸的環境中存活並繁殖，還是導致慢性胃炎、消化性潰瘍等胃部疾病的主要病原體之一。

近日，中國科學院上海免疫與感染研究所及其合作者首次發現了一種起源於數十萬年前的幽門螺桿菌新亞種。研究成果發表於《自然》（Nature）。

▲Nature官網論文截圖

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“神奇細菌”在哪裏

自人類誕生以來，幽門螺桿菌就與我們同在，能否找出其歷史的更多細節？

懷揣着這樣的科研設想，研究團隊聯合瑞典、日本的科學家，收集了全球近7000個幽門螺桿菌的基因組數據集。最終，他們在部分土著人羣中發現了幽門螺桿菌的全新生態亞種，研究人員將其命名為“Hardy”，寓意為“耐寒的”。

所謂生態亞種，是指同一物種因適應不同生態環境，而在基因上表現出微小差異的種羣。這項研究將幽門螺桿菌的生態亞種定義為兩類，其中一類是當下普遍流行的“Ubiquitous”，另一類就是這次新發現的亞種“Hardy”。

儘管這些生態亞種的基因組在大多數情況下源自相似的共同祖先，但在“Hardy”型的基因組中，約有100個基因展示了與當下常見的幽門螺桿菌不同的DNA鹼基變異。

▲Hardy和Ubiquitous生態亞種基因庫的分化和傳播

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遷徙傳播中走失的生態亞種

研究人員推測，幽門螺桿菌在人類走出非洲之前就分化成了兩個高度不同的亞種，並隨着人類的遷移在全球傳播。不同亞種展現了獨立的基因組演化模式，體現出各自獨特的進化歷程。

此次新發現的亞種“Hardy”在世界大部分地區已經滅絕。在“Hardy”生態亞種中，大多數菌株編碼了額外的依賴鐵的尿素酶，這一點與來源於食肉動物宿主的幽門螺桿菌一致。此外，這些菌株還具有編碼空泡毒素（vacA）的串聯重複，進一步支持了它們在進化上的相似性和適應性。

研究人員提出，Hardy專門適應於生活在以肉類或魚類為主食的人（肉食者）的胃中；因此，今天我們胃中細菌的遺傳變異可能揭示了祖先的飲食習慣。

研究進一步揭示，在大型貓科動物中發現的獵豹螺桿菌（H. acinonychis）以及新發現的與靈長類動物相關的譜系均歸屬於Hardy生態亞種。由於幽門螺桿菌通常僅在人體中存在，此次靈長類動物中的新發現表明幽門螺桿菌可能經歷了從人類宿主向動物宿主的跨物種傳播。

▲全球幽門螺桿菌的平均祖先分佈圖

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解鎖治療新篇章

新亞種的發現還將幽門螺桿菌與人類的關聯歷史向前推進了一步。團隊初步研究了人類飲食歷史對生態亞種分佈的影響，對“Hardy”生態亞種的致病性與人類飲食之間關聯進行了初步討論。

未來，團隊希望逐步解開幽門螺桿菌適應人類胃環境以及飲食習慣的適應性進化機制謎題，助力根除該病原菌以及設計更好的精準治療方法。

來源：中國科學院上海免疫與感染研究所