本地科研團隊用人工智能開發新平台 加速癌症藥物研發 | 聯合早報
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本地科研團隊獲得撥款近1800萬元,用於開發利用多種技術與人工智能來分析生物標誌物的新數據平台,以促進癌症等疾病的藥物研發。
這個平台將為研究人員和臨牀醫生,提供一種基於細胞和位置的疾病生物標誌物分析方法,旨在加速我國及亞洲的藥物研發工作。
這項四年的研究項目由新加坡科技研究局屬下的新加坡基因組研究院(Genome Institute of Singapore),攜同局生物資訊研究院、新加坡國立癌症中心,以及新加坡中央醫院的專家研發。
他們將繪製組織切片內分子位置的空間組學(spatial omics)技術、病理實驗室顯微鏡圖像的組織成像以及臨牀數據相結合,利用人工智能發現新的藥物靶點。
新數據平台將專注於癌症,包括肺癌、乳腺癌、結腸癌、肝癌和胃癌、慢性腎病,以及脂肪肝病。
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作為項目的首席研究員,新加坡基因組研究院系統生物學和數據分析實驗室高級組長普拉巴卡(Shyam Prabhakar)博士指出,靶點發現是藥物開發中的瓶頸,當前方法成功率有限。
他説,新平台旨在通過關注參與細胞間相互作用的分子來改善靶點發現。“細胞間相互作用影響細胞的生長、通訊和對治療的反應。理解並操縱這些相互作用,可以幫助開發更有效的治療方法。”
他提到,70%的現有藥物,包括徹底改變癌症治療的免疫療法藥物,都以這些參與細胞相互作用的分子為靶點。
利用檔案庫組織樣本 發現新藥物靶點
團隊將利用新保集團數碼病理學檔案庫裏15萬多名患者的100多萬張顯微組織圖像,以及過去10年在新保集團組織庫裏的2萬多個組織樣本進行研究,利用人工智能推斷細胞間的相互作用,以發現新的藥物靶點。
除了藥物研發之外,平台還將幫助定義疾病亞型(subtypes),據此對患者進行分類,以提高診斷準確性,並制定治療計劃來獲得更好的結果。
平台數據也可以幫助專家從分子水平上了解藥物的作用原理,這對於識別同一種藥物可治療的其他疾病非常重要。
團隊已利用該平台分析,確定了兩種對癌症檢測和治療有影響的結腸癌亞型。研究成果已發表在學術期刊《自然—遺傳學》(Nature Genetics)上。
中央醫院病理學處長林潔鋒教授説,新平台通過引入人工智能驅動的疾病治療方法,發現新藥物靶點,有望推動醫療進步並提高患者治療效果。
他説:“數據庫共享可以讓病理學家對存儲多年的數據進行註釋,支持多種不同分析方法。”