科研人員重建5萬多年前猛獁象染色體3D結構 | 聯合早報
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一個國際研究團隊根據一具保存良好的猛獁象樣本,重建了5.2萬年前的猛獁象染色體3D結構。這項研究結果讓科研人員能夠在基因組層面更深入地瞭解猛獁象。
新華社報道,由美國貝勒醫學院等機構研究人員組成的國際團隊在《細胞》雜誌上發表論文説,他們在五年裏測試了數十個樣本,最終選中了於2018年在西伯利亞東北部挖掘出的一具保存異常良好的猛獁象樣本。
這隻猛獁象死後不久就被凍幹,而脱水樣本中的細胞核結構可以保存很長時間,研究人員由此可探究樣本的染色體組核型,即染色體的數目、大小和形態特徵等。
研究人員使用了一種名為Hi-C的方法從猛獁象耳後皮膚樣本中提取DNA,將其相關物理信息與DNA測序相結合,以識別相互作用的DNA片段,並使用當今大象的基因組作為模板,成功創建了該猛獁象基因組的有序圖譜,並建立相關的染色體3D結構。
進一步的分析顯示,被研究的這頭猛獁象有28條染色體,這與當今亞洲象和非洲象的染色體數量相同,該猛獁象的染色體還保留了大量物理完整性和細節。此外,與其近親亞洲象的皮膚細胞相比,猛獁象的皮膚細胞具有不同的基因激活模式,包括可能與其毛髮和耐寒性相關的基因等。
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儘管這項研究中使用的方法取決於保存完好的古老樣本,但研究人員樂觀地認為,該方法也可用於研究其他古代DNA標本等。