中國科學家運用AI算法發現大量RNA病毒 | 聯合早報

中國科學家運用人工智能（AI）算法，發現了16萬餘種RNA病毒，有助於在疫情暴發時更快鎖定潛在病原體。

據中新社報道，中山大學星期三（10月9日）晚發佈消息，中山大學醫學院施莽教授團隊與阿里雲李兆融團隊在《細胞》（Cell）雜誌發表論文，報告了全球範圍的180個超羣、16萬餘種RNA病毒的發現，大幅擴展全球RNA病毒的多樣性。

據介紹，傳統的病毒發現方法包括病毒分離和生命組學的生物信息學分析，高度依賴既有知識，面對RNA病毒這種高度分化、種類繁多且容易變異的病毒識別效率低。該研究團隊開發的LucaProt人工智能算法能夠對病毒和非病毒基因組序列深度學習，並在數據集中自主判斷病毒序列。

利用這套算法，研究團隊在來自全球生物環境樣本的1萬零487份RNA測序數據中發現了超過51萬條病毒基因組，代表超過16萬個潛在病毒種及180個RNA病毒超羣。其中23個超羣無法通過序列同源方法識別，被稱為病毒圈的“暗物質”。

通過進一步分析，團隊報告了迄今最長的RNA病毒基因組，長度達到4萬7250個核苷酸；發現了超出以往認知的基因組結構，展現出RNA病毒基因組進化的靈活性；識別到多種病毒功能蛋白，特別是與細菌相關的功能蛋白，進一步表明還有更多類型的RNA噬菌體亟待探索；發現在南極底泥、深海熱泉、活性污泥和鹽鹼灘等極端環境中，RNA病毒的數量和多樣性仍然較高。

“人工智能的算法模型能夠挖掘出我們之前忽略或根本不知道的病毒，這種能力在疾病防控和新病原的快速識別中尤為重要。特別是在疫情暴發時，人工智能的速度和精度可以幫助科學家更快地鎖定潛在病原體。”施莽介紹説，研究顯示病毒的多樣性遠超人類想象，人類目前所看到的仍是冰山一角，未來病毒分類體系可能會有大規模的調整。