劍橋大學開發新分析工具優化病原體變種監測 | 聯合早報

zaobao

2025-01-04

英國劍橋大學領銜的研究團隊近日宣佈，他們開發出一種名為“phylowave”的分析工具，能追蹤病原體家譜中種羣組成的動態變化，自動識別具高危險性新變種，從而提高變種鑑定效率和準確性，幫助公共衞生機構及時作出回應。

新華社報道，這個分析工具能根據病原體不同變種的親緣關係，繪製系統發生樹（Phylogenetic Tree），記錄不同基因型之間的進化關係。研究團隊在《自然》雜誌上發表的論文中指出，phylowave能通過分析受感染人羣的病原體樣本，量化各變種的適應環境能力，並自動識別適應性和傳播力較強的新變種。

這個工具已在對甲型H3N2流感病毒、百日咳桿菌（Bordetella pertussis）和結核分枝桿菌（Mycobacterium tuberculosis）等病原體的分析中得到驗證。研究發現，新的分析工具不僅能識別已知的主要變種，還能發現一些此前未知的、適應性較強的變種。

細菌和病毒的進化速度極快，可隨時出現傳播力更強、更擅長逃避免疫系統攻擊或能對抗疫苗和藥物作用的新變種。及時識別這些變種及其適應性優勢，是應對傳染病挑戰的關鍵。

傳統基因分析方法在新變種鑑定效率和精度上存在不足，且確認新變種往往依賴專家團隊討論，帶有一定主觀性。與之相比，phylowave在效率和客觀性上更具優勢，對病原體樣本的要求也更低，即便樣本數量較少或抽樣存在偏差，依然能有效分析。

延伸閲讀

中國科學家運用AI算法發現大量RNA病毒 [世衞組織確定17種病原體開發新疫苗重點關注低收入國家